在networkx.write_gexf中分配默认命名空间

时间:2013-02-05 04:33:55

标签: python networkx

将python的networkx库生成的这段代码作为有效的GEXF文件,我无法在我更改xmlns的文档中找到任何地方:ns0而不是xmlns:viz ...符合GEXF的命名空间。

<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?><gexf xmlns:ns0="http://www.gexf.net/1.1draft/viz"     
version="1.1" xmlns="http://www.gexf.net/1.1draft" xmlns:viz="http://www.gexf.net/1.1draft/viz"    
xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance"   
xsi:schemaLocation="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance">

  <graph defaultedgetype="directed" mode="static">
<attributes class="node" mode="static">
  <attribute id="0" title="origin" type="double" />
  <attribute id="1" title="size" type="integer" />
</attributes>
<nodes>
  <node id="0" label="Vijana Amani Pamoja (VAP)">
    <ns0:color b="70" g="11" r="160" />
    <ns0:size value="10" />
    <attvalues>
      <attvalue for="0" value="1.25" />
      <attvalue for="1" value="10" />
    </attvalues>
  </node>

某处我可能已经覆盖了networkx的write_gexf函数的默认命名空间的VIZ部分,但我不知道我在哪里做了 - 所以我在这里问。

networkx.write_gexf(G,f) # G is the graph and f is the file to write.

(编者): 节点说ns0:...而不是viz:...如GEXF文档中所示。这会导致与使用viz参数的其他GEXF库存在兼容性问题(并且无法找到它们)。

1 个答案:

答案 0 :(得分:0)

我遇到了同样的问题,我更新了gexf.py中GEXFWriter类中的“add_viz”函数,如下所示:

 def add_viz(self,element,node_data):
    viz=node_data.pop('viz',False)
    if viz:
        color=viz.get('color')
        if color is not None:
            e=Element("viz:color")
            e.attrib['r']=str(color.get('r'))
            e.attrib['g']=str(color.get('g'))
            e.attrib['b']=str(color.get('b'))
            if self.VERSION!='1.1':
                e.attrib['a']=str(color.get('a'))
            e.text=" "
            element.append(e)
        size=viz.get('size')
        if size is not None:
            e=Element("viz:size")
            e.attrib['value']=str(size)
            e.text=" "
            element.append(e)

        thickness=viz.get('thickness')
        if thickness is not None:
            e=Element("viz:thickness")
            e.attrib['value']=str(thickness)
            e.text=" "
            element.append(e)

        shape=viz.get('shape')
        if shape is not None:
            if shape.startswith('http'):
                e=Element("viz:shape")
                e.attrib['value']= 'image'
                e.attrib['uri']= str(shape)
            else:
                e=Element("viz:shape")
                e.attrib['value']= str(shape)
            e.text=" "
            element.append(e)

        position=viz.get('position')
        if position is not None:
            e=Element("viz:position")
            e.attrib['x']= str(position.get('x'))
            e.attrib['y']= str(position.get('y'))
            e.attrib['z']= str(position.get('z'))
            e.text=" "
            element.append(e)
    return node_data

这解决了我使用的GEXF库/工具的兼容性问题。

贝斯茨, ZP