使用ggplot在R中添加错误栏

Question

我想在R中用LWP绘制两个分类变量（治疗）。

我想改变点的颜色（填充）以对应变量rootpatH（每个处理中一个点）。

如果差异很大，我还想添加一个表示法。

Plants.means<-aggregate(Plants[10:44],Plants[c(6,9)],mean,na.rm=TRUE)

SE<-function(x)(sd(x,na.rm=TRUE)/ (length(x)-sum(is.na(x)))^0.5)


ggplot(Plants.means, aes(x=Treat, y=Yield, group=1)) +
geom_errorbar(width=.1, aes(ymin=Yield-SE(Plants.means$Yield), ymax=Yield+SE(Plants.means$Yield))) +
geom_point(shape=21, size=3, fill="white") +
ylim(0,1750)

我还想更改误差线以代表95％CI而不是SE。

善待是绝对的 rootpatH是绝对的 LWP_meas2是连续的

Answer 1

正如Ben所说，你可能想要这样的东西（由于没有提供数据，因此没有必要进行测试：

with( Plants.means,
               errbar(x =Treat, y = LWP_Meas2, 
                                yplus =  LWP_Meas2 + SE( LWP_Meas2), 
                                yminus = LWP_Meas2 - SE( LWP_Meas2), 
       add=T,na.rm=TRUE, col=c("blue", "hotpink"))
      )

Answer 2

error <- function(x)(qt(0.975,df=length(x)-1)*sd(x)/sqrt(length(x)))

ggplot(Plants.means,aes(x=Treat, y=Yield, colour=rootpatH, group=rootpatH)) +
geom_errorbar(aes(ymin=Yield-error(Plants.means$Yield),ymax=Yield+error(Plants.means$Yield)), colour="black",width=.1, position=pd) +
geom_point(position=pd, size=4)