我有两列数据。在一列中,它是日期,在另一列中,它是流量数据。
我能够将数据作为日期和流量数据读取。我使用了以下代码:
creek <- read.csv("creek.csv")
library(ggplot2)
creek[1:10,]
colnames(creek) <- c("date","flow")
creek$date <- as.Date(creek$date, "%m/%d/%Y")
我的数据链接是https://www.dropbox.com/s/eqpena3nk82x67e/creek.csv
现在,我想找到每年的摘要。我想特别了解平均值,中位数,最大值等。
感谢。
此致 Jdbaba
答案 0 :(得分:17)
以下是基础R的两种方法。
第一个使用cut
,split
和lapply
以及summary
。
creekFlowSummary <- lapply(split(creek, cut(creek$date, "1 year")),
function(x) summary(x[2]))
这会创建一个list
。您可以通过访问相应的列表索引或名称来查看不同年份的摘要。
creekFlowSummary[1]
# $`1999-01-01`
# flow
# Min. :0.3187
# 1st Qu.:0.3965
# Median :0.4769
# Mean :0.6366
# 3rd Qu.:0.5885
# Max. :7.2560
#
creekFlowSummary["2000-01-01"]
# $`2000-01-01`
# flow
# Min. :0.1370
# 1st Qu.:0.1675
# Median :0.2081
# Mean :0.2819
# 3rd Qu.:0.2837
# Max. :2.3800
第二个使用aggregate
:
aggregate(flow ~ cut(date, "1 year"), creek, summary)
# cut(date, "1 year") flow.Min. flow.1st Qu. flow.Median flow.Mean flow.3rd Qu. flow.Max.
# 1 1999-01-01 0.3187 0.3965 0.4770 0.6366 0.5885 7.2560
# 2 2000-01-01 0.1370 0.1675 0.2081 0.2819 0.2837 2.3800
# 3 2001-01-01 0.1769 0.2062 0.2226 0.2950 0.2574 2.9220
# 4 2002-01-01 0.1279 0.1781 0.2119 0.5346 0.4966 14.3900
# 5 2003-01-01 0.3492 0.4761 0.7173 1.0350 1.0840 10.1500
# 6 2004-01-01 0.4178 0.5379 0.6524 0.9691 0.9020 11.7100
# 7 2005-01-01 0.4722 0.6094 0.7279 1.2340 1.0900 17.7200
# 8 2006-01-01 0.2651 0.3275 0.4282 0.5459 0.5758 3.3510
# 9 2007-01-01 0.2784 0.3557 0.4041 0.6331 0.6125 9.6290
# 10 2008-01-01 0.4131 0.5430 0.6477 0.8792 0.9540 4.5960
# 11 2009-01-01 0.3877 0.4572 0.5945 0.8465 0.8309 6.3830
请注意aggregate
解决方案:摘要信息的所有是单个矩阵。在输出上查看str
以查看我的意思。
xts
当然还有其他方法可以做到这一点。一种方法是使用xts
包。
首先,将您的数据转换为xts
:
library(xts)
creekx <- xts(creek$flow, order.by=creek$date)
然后,使用apply.yearly
以及您感兴趣的任何功能。
以下是年平均值:
apply.yearly(creekx, mean)
# [,1]
# 1999-12-31 0.6365604
# 2000-12-31 0.2819057
# 2001-12-31 0.2950348
# 2002-12-31 0.5345666
# 2003-12-31 1.0351742
# 2004-12-31 0.9691180
# 2005-12-31 1.2338066
# 2006-12-31 0.5458652
# 2007-12-31 0.6331271
# 2008-12-31 0.8792396
# 2009-09-30 0.8465300
年度最大值:
apply.yearly(creekx, max)
# [,1]
# 1999-12-31 7.256
# 2000-12-31 2.380
# 2001-12-31 2.922
# 2002-12-31 14.390
# 2003-12-31 10.150
# 2004-12-31 11.710
# 2005-12-31 17.720
# 2006-12-31 3.351
# 2007-12-31 9.629
# 2008-12-31 4.596
# 2009-09-30 6.383
或者,将它们组合在一起:apply.yearly(creekx, function(x) cbind(mean(x), sum(x), max(x)))
data.table
data.table
包也可能对您有用,特别是在您处理大量数据时。这是data.table
方法。关键是在您的“日期”列中使用as.IDate
,同时阅读以下数据:
library(data.table)
DT <- data.table(date = as.IDate(creek$date), creek[-1])
DT[, list(mean = mean(flow),
tot = sum(flow),
max = max(flow)),
by = year(date)]
# year mean tot max
# 1: 1999 0.6365604 104.3959 7.256
# 2: 2000 0.2819057 103.1775 2.380
# 3: 2001 0.2950348 107.6877 2.922
# 4: 2002 0.5345666 195.1168 14.390
# 5: 2003 1.0351742 377.8386 10.150
# 6: 2004 0.9691180 354.6972 11.710
# 7: 2005 1.2338066 450.3394 17.720
# 8: 2006 0.5458652 199.2408 3.351
# 9: 2007 0.6331271 231.0914 9.629
# 10: 2008 0.8792396 321.8017 4.596
# 11: 2009 0.8465300 231.1027 6.383
答案 1 :(得分:3)
您可以使用@ananda的代码创建一个带有年份的附加列,即带有剪切的行。假设列名是year,您可以使用plyr包中的ddply:
ddply(creek, .(year), summarise, mm = mean(flow), me = median(flow), ...etc)
答案 2 :(得分:2)
@Pauls代码可以使用plyr包的下一次迭代dplyr package重写。
summarize()
creek <- mutate(creek, year = as.POSIXlt(date)$year + 1900)
years <- group_by(creek, year)
summarize(years, mm= mean(flow),
tot= sum(flow),
max = max(flow, na.rm = TRUE))
以下是Roger Peng的nice dplyr tutorial。
答案 3 :(得分:0)
基本R
回复非常基本,但是您可以始终使用summary()
和subset()
来查看特定年份的概述。这样做的好处是准备需要几秒钟。
summary(subset(df,Year == '####'))