在Ubuntu 12.04LTS上安装CASSAVA的错误

时间:2013-01-29 23:02:48

标签: gcc ubuntu gzip bioinformatics bzip2

我正在尝试在Ubuntu 12.04 LTS上安装CASAVA Bcl2Fastq 1.8.3(为CentOS开发)。但是,我收到错误消息“不支持gzip压缩”,安装失败。幸运的是,我找到了解决这个问题的方法:

  sudo ln -s /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libpthread* /usr/lib
  sudo ln -s /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libz.so /usr/lib

但是现在我又得到了另一个类似的错误“不支持bzip2压缩”。我想知道我是否可以做类似的事情来解决这个错误?

2 个答案:

答案 0 :(得分:3)

我终于通过将/ usr / lib / x86_64-linux-gnu /中的bzip2库文件链接到/ usr / lib来解决这个问题:

  sudo ln -s /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libbz2* /usr/lib

但我想知道为什么gcc无法自动找到库文件,这是我的Unbuntu安装问题还是CASAVA Bcl2Fastq 1.8.3软件的一些不兼容性(因为它是在CentOS上开发和测试的)?

答案 1 :(得分:2)

对于那些返回此问题的人 - 如果在/ usr / lib / x86_64-linux-gnu /下找不到任何合适的libbz2 *文件,请尝试:

  

sudo apt-get install libbz2-dev libbz2