合并列以删除NA

时间:2013-01-28 13:52:11

标签: r merge na

我在R中有一些列,对于每一行,其中一列只有一个值,其余的将是NA。我想将这些组合成一个具有非NA值的列。有谁知道这样做的简单方法。例如,我可以如下:

data <- data.frame('a' = c('A','B','C','D','E'),
                   'x' = c(1,2,NA,NA,NA),
                   'y' = c(NA,NA,3,NA,NA),
                   'z' = c(NA,NA,NA,4,5))

所以我会

'a' 'x' 'y' 'z'  
 A   1   NA  NA  
 B   2   NA  NA  
 C  NA   3   NA  
 D  NA   NA  4  
 E  NA   NA  5

我会得到

 'a' 'mycol'  
  A   1  
  B   2  
  C   3  
  D   4  
  E   5  

包含NA的列的名称会根据查询中较早的代码而更改,因此我无法显式调用列名,但是我将包含NA的列的列名存储为向量,例如在此示例中cols <- c('x','y','z'),因此可以使用data[, cols]调用列。

任何帮助都将不胜感激。

由于

10 个答案:

答案 0 :(得分:20)

基于dplyr::coalesce的解决方案可以是:

data %>% mutate(mycol = coalesce(x,y,z)) %>%
         select(a, mycol)
#   a mycol
# 1 A     1
# 2 B     2
# 3 C     3
# 4 D     4
# 5 E     5 

数据

data <- data.frame('a' = c('A','B','C','D','E'),
                 'x' = c(1,2,NA,NA,NA),
                 'y' = c(NA,NA,3,NA,NA),
                 'z' = c(NA,NA,NA,4,5))

答案 1 :(得分:18)

您可以使用unlist将列转换为一个向量。之后,na.omit可用于删除NA

cbind(data[1], mycol = na.omit(unlist(data[-1])))

   a mycol
x1 A     1
x2 B     2
y3 C     3
z4 D     4
z5 E     5

答案 2 :(得分:11)

我会将rowSums()na.rm = TRUE参数一起使用:

cbind.data.frame(a=data$a, mycol = rowSums(data[, -1], na.rm = TRUE))

给出:

> cbind.data.frame(a=data$a, mycol = rowSums(data[, -1], na.rm = TRUE))
  a mycol
1 A     1
2 B     2
3 C     3
4 D     4
5 E     5

您必须直接调用该方法(cbind.data.frame),因为上面的第一个参数不是数据框。

答案 3 :(得分:11)

这是一个更通用(但更简单)的解决方案,它扩展到具有无序NA的所有列类型(因子,字符等)。该策略只是使用is.na将其他列的非NA值合并到合并列中以进行索引:

data$m = data$x  # your new merged column start with x
data$m[!is.na(data$y)] = data$y[!is.na(data$y)]  # merge with y
data$m[!is.na(data$z)] = data$z[!is.na(data$z)]  # merge with z

> data
  a  x  y  z m
1 A  1 NA NA 1
2 B  2 NA NA 2
3 C NA  3 NA 3
4 D NA NA  4 4
5 E NA NA  5 5

请注意,如果同一行中有多个非NA值,则会覆盖m中的现有值。如果您有很多列,则可以通过循环colnames(data)来自动执行此操作。

答案 4 :(得分:4)

这样的东西?

data.frame(a=data$a, mycol=apply(data[,-1],1,sum,na.rm=TRUE))

给出:

  a mycol
1 A     1
2 B     2
3 C     3
4 D     4
5 E     5

答案 5 :(得分:1)

max也有效。也适用于字符串向量。

cbind(data[1], mycol=apply(data[-1], 1, max, na.rm=T))

答案 6 :(得分:0)

在相关链接(suppress NAs in paste())中,我提供的paste版本带有na.rm选项(不幸的名称为paste5)。

这样代码变成

cols <- c("x", "y", "z")
cbind.data.frame(a = data$a, mycol = paste2(data[, cols], na.rm = TRUE))

paste5的输出是一个字符,如果您有字符数据,则该字符有效,否则您需要强制转换为您想要的类型。

答案 7 :(得分:0)

虽然这不是OP案例,但似乎有些人喜欢基于总和的方法,如何在均值和模式下思考,使答案更具普遍性。这个答案与标题相符,这是许多人会发现的。

data <- data.frame('a' = c('A','B','C','D','E'),
                   'x' = c(1,2,NA,NA,9),
                   'y' = c(NA,6,3,NA,5),
                   'z' = c(NA,NA,NA,4,5))

splitdf<-split(data[,c(2:4)], seq(nrow(data[,c(2:4)])))

data$mean<-unlist(lapply(splitdf, function(x)  mean(unlist(x), na.rm=T) ) )
data$mode<-unlist(lapply(splitdf, function(x)  {
  tab <- tabulate(match(x, na.omit(unique(unlist(x) )))); 
                  paste(na.omit(unique(unlist(x) ))[tab == max(tab) ], collapse = ", " )}) )

data
  a  x  y  z     mean mode
1 A  1 NA NA 1.000000    1
2 B  2  6 NA 4.000000 2, 6
3 C NA  3 NA 3.000000    3
4 D NA NA  4 4.000000    4
5 E  9  5  5 6.333333    5

答案 8 :(得分:0)

使用dplyrtidyr的一种可能性是:

data %>%
 gather(variables, mycol, -1, na.rm = TRUE) %>%
 select(-variables)

   a mycol
1  A     1
2  B     2
8  C     3
14 D     4
15 E     5

此处将数据从宽格式转换为长格式,但不包括该操作的第一列并删除了NA。

答案 9 :(得分:0)

如果你想坚持下去,

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