我有一大片(数百万行)融化data.table
,通常melt
- 样式展开variable
和value
列。我需要以宽泛的形式转换表(滚动变量)。问题是数据表还有一个名为data
的列表列,我需要保留它。这使得无法使用reshape2
,因为dcast
无法处理非原子列。因此,我需要自己卷起来。
由于列表列,previous question关于使用融合数据表的答案不适用于此处。
我对我提出的解决方案不满意。我正在寻找更简单/更快实施的建议。
x <- LETTERS[1:3]
dt <- data.table(
x=rep(x, each=2),
y='d',
data=list(list(), list(), list(), list(), list(), list()),
variable=rep(c('var.1', 'var.2'), 3),
value=seq(1,6)
)
# Column template set up
list_template <- Reduce(
function(l, col) { l[[col]] <- col; l },
unique(dt$variable),
list())
# Expression set up
q <- substitute({
l <- lapply(
list_template,
function(col) .SD[variable==as.character(col)]$value)
l$data = .SD[1,]$data
l
}, list(list_template=list_template))
# Roll up
dt[, eval(q), by=list(x, y)]
x y var.1 var.2 data
1: A d 1 2 <list>
2: B d 3 4 <list>
3: C d 5 6 <list>
答案 0 :(得分:1)
我有一些作弊的方法可以解决这个问题 - 重要的是,我认为每个x,y,列表组合都是独一无二的!如果没有,请忽略。
我将创建两个单独的数据表,第一个是没有数据列表对象的数据,第二个只有唯一的数据列表对象和一个键。然后将它们合并在一起以获得所需的结果。
require(data.table)
require(stringr)
require(reshape2)
x <- LETTERS[1:3]
dt <- data.table(
x=rep(x, each=2),
y='d',
data=list(list("a","b"), list("c","d")),
variable=rep(c('var.1', 'var.2'), 3),
value=seq(1,6)
)
# First create the dcasted datatable without the pesky list objects:
dt_nolist <- dt[,list(x,y,variable,value)]
dt_dcast <- data.table(dcast(dt_nolist,x+y~variable,value.var="value")
,key=c("x","y"))
# Second: create a datatable with only unique "groups" of x,y, list
dt_list <- dt[,list(x,y,data)]
# Rows are duplicated so I'd like to use unique() to get rid of them, but
# unique() doesn't work when there's list objects in the data.table.
# Instead so I cheat by applying a value to each row within an x,y "group"
# that is unique within EACH group, but present within EVERY group.
# Then just simply subselect based on that unique value.
# I've chosen rank(), but no doubt there's other options
dt_list <- dt_list[,rank:=rank(str_c(x,y),ties.method="first"),by=str_c(x,y)]
# now keep only one row per x,y "group"
dt_list <- dt_list[rank==1]
setkeyv(dt_list,c("x","y"))
# drop the rank since we no longer need it
dt_list[,rank:=NULL]
# Finally just merge back together
dt_final <- merge(dt_dcast,dt_list)
答案 1 :(得分:1)
这个老问题激起了我的好奇心,因为data.table
自2013年以来已得到显着改善。
但是,即使使用data.table
1.11.4版
dcast(dt, x + y + data ~ variable)
仍然返回错误
公式中指定的列不能为列表类型
解决方法遵循jonsedar's answer的概述:
data
和x
分组的列表列y
x
和y
上加入两个部分结果但使用实际的data.table
语法的功能,例如on
参数:
dcast(dt, x + y ~ variable)[
dt[, .(data = .(first(data))), by = .(x, y)], on = .(x, y)]
x y var.1 var.2 data 1: A d 1 2 <list> 2: B d 3 4 <list> 3: C d 5 6 <list>
列表列data
通过采用第一个元素进行汇总。这符合OP的代码行
l$data = .SD[1,]$data
还将选择第一个元素。