Question

我正在尝试寻找一个minhash开源实现，我可以利用它实现我的工作。

我需要的功能非常简单，给定一个输入，实现应返回其minhash。

首选python或C实现，以防万一我需要破解它才能为我工作。

任何指针都会有很大的帮助。

问候。

Answer 1

您应该按顺序查看以下开源库。所有这些都是Python，并展示如何使用LSH / MinHash计算文档相似性：

lsh
LSHHDC : Locality-Sensitive Hashing based High Dimensional Clustering
MinHash

Answer 2

看看datasketch library。它支持序列化和合并。它是在纯python中实现的，没有外部依赖。 Go version具有完全相同的功能。

Answer 3

如果您有兴趣研究minhash算法，这是一个非常简单的实现并进行了一些讨论。

要为集合生成MinHash签名，我们创建一个长度为 $N$ 的向量，其中所有值均设置为正无穷大。我们还创建了 $N$ 函数，这些函数接受输入整数并将该值置换。 $i^{th}$ 函数将全权负责更新向量中的 $i^{th}$ 值。给定这些值，我们可以通过将集合中的每个值传递给每个 $N$ 排列函数来计算集合的minhash签名。如果 $i^{th}$ 置换函数的输出低于向量的 $i^{th}$ 的值，我们用置换函数的输出替换该值（这就是为什么哈希称为“ min -hash”）。让我们在Python中实现它：

from scipy.spatial.distance import cosine
from random import randint
import numpy as np

# specify the length of each minhash vector
N = 128
max_val = (2**32)-1

# create N tuples that will serve as permutation functions
# these permutation values are used to hash all input sets
perms = [ (randint(0,max_val), randint(0,max_val)) for i in range(N)]

# initialize a sample minhash vector of length N
# each record will be represented by its own vec
vec = [float('inf') for i in range(N)]

def minhash(s, prime=4294967311):
  '''
  Given a set `s`, pass each member of the set through all permutation
  functions, and set the `ith` position of `vec` to the `ith` permutation
  function's output if that output is smaller than `vec[i]`.
  '''
  # initialize a minhash of length N with positive infinity values
  vec = [float('inf') for i in range(N)]

  for val in s:

    # ensure s is composed of integers
    if not isinstance(val, int): val = hash(val)

    # loop over each "permutation function"
    for perm_idx, perm_vals in enumerate(perms):
      a, b = perm_vals

      # pass `val` through the `ith` permutation function
      output = (a * val + b) % prime

      # conditionally update the `ith` value of vec
      if vec[perm_idx] > output:
        vec[perm_idx] = output

  # the returned vector represents the minimum hash of the set s
  return vec

仅此而已！为了演示如何使用此实现，我们仅举一个简单的示例：

import numpy as np

# specify some input sets
data1 = set(['minhash', 'is', 'a', 'probabilistic', 'data', 'structure', 'for',
        'estimating', 'the', 'similarity', 'between', 'datasets'])
data2 = set(['minhash', 'is', 'a', 'probability', 'data', 'structure', 'for',
        'estimating', 'the', 'similarity', 'between', 'documents'])

# get the minhash vectors for each input set
vec1 = minhash(data1)
vec2 = minhash(data2)

# divide both vectors by their max values to scale values {0:1}
vec1 = np.array(vec1) / max(vec1)
vec2 = np.array(vec2) / max(vec2)

# measure the similarity between the vectors using cosine similarity
print( ' * similarity:', 1 - cosine(vec1, vec2) )

这返回〜.9作为这些向量之间相似性的度量。

虽然我们只比较了上面的两个minhash向量，但是我们可以使用“ Locality Sensitive Hash”来更简单地比较它们。为此，我们可以构建一个字典，将$ W $ MinHash向量分量的每个序列映射到用于构造MinHash向量的集合的唯一标识符。例如，如果W = 4并有一个集合S1，我们从中得出一个MinHash向量[111,512,736,927,817...]，我们将在每个四个MinHash值的序列中添加S1标识符该向量：

d[111-512-736-927].append('S1')
d[512-736-927-817].append('S1')
...

对所有集合执行此操作后，我们可以检查字典中的每个键，并且如果该键具有多个不同的集合ID，则我们有理由相信这些集合是相似的。实际上，在字典的单个值中一对集合ID出现的次数越多，两个集合之间的相似性就越大。通过这种方式处理数据，我们可以将识别所有相似集合对的时间降低到大致线性的时间！

Answer 4

我建议你this library，特别是如果你需要坚持。在这里，您可以使用redis来存储/检索所有数据。

您可以选择redis数据库，或者只使用内置的内存python词典。

使用redis的性能，至少在本地计算机上运行redis服务器时，几乎与通过标准python词典实现的性能相同。

您只需指定配置字典，例如

config = {"redis": {"host": 'localhost', "port": '6739', "db": 0}}

并将其作为参数传递给LSHash类构造函数。

你能建议一个好的minhash实现吗？

4 个答案: