我刚刚开始使用R,并希望得到一个非线性最小二乘拟合nls(...)到公式y = A(1-exp(-bL))+ R. 我通过
定义我的函数g> g<-function(x,y,A,b,R) {
y~A(1-exp(-bx))+R
}
并希望通过
执行nls>nls((y~g(x,y,A,b,R)),data=Data, start=list(A=-2,b=0,R=-5))
最后我收到以下错误消息。
>Error in lhs - rhs : non-numeric argument to binary operator
我想这只是另一个初学者的一个愚蠢的基本错误,但如果有人能帮助我,我会非常高兴。
接下来的问题是,我是否可以在我的图表中实现拟合曲线
>plot(x,y,main="VI.20.29")
感谢大家花时间阅读并希望回答我的问题!
详细信息: 我有一个表格,其中包含x值(Light.intensity)和y值(例如VI.20.29)
> photo.data<-read.csv("C:/X/Y/Z.csv", header=T)
> names(photo.data)
[1] "Light.intensity" "SR.8.6" "SR.8.7"
[4] "SR.8.18" "SR.8.20" "VI.20.1"
[7] "VI.20.5" "VI.20.20" "VI.20.29"
[10] "DP.19.1" "DP.19.15" "DP.19.33"
[13] "DP.19.99"
> x<-photo.data$Light.intensity
> x
[1] 0 50 100 200 400 700 1000 1500 2000
> y<-photo.data$VI.20.29
> y
[1] -2.76 -2.26 -1.72 -1.09 0.18 0.66 1.47 1.48 1.63
> plot(x,y,main="VI.20.29")
> Data<-data.frame(x,y)
> Data
x y
1 0 -2.76
2 50 -2.26
3 100 -1.72
4 200 -1.09
5 400 0.18
6 700 0.66
7 1000 1.47
8 1500 1.48
9 2000 1.63
> g<-function(x,y,A,b,R) {
+ y~A(1-exp(-bx))+R
+ }
> nls((y~g(x,y,A,b,R)),data=Data, start=list(A=-2,b=0,R=-5))
Error in lhs - rhs : non-numeric argument to binary operator
答案 0 :(得分:1)
问题是你在一个函数中调用一个函数。当函数y~g(...)
本身调用g(...)
时,您会说y~(other variables)
。它在某种程度上是“重复计算”。
只是做:
nls(y~A*(1-exp(-b*x))+R, data=Data, start=list(A=-2,b=0,R=-5))
答案 1 :(得分:1)
您对参数的初步猜测是偏离的。我将您的数据保存在'data.csv'中 对于这个例子,收敛然后做图...为了得到这个,我 调整参数以获得接近,然后nls适合...
df <- read.csv('data.csv')
x <- df$x
y <- df$y
plot(x,y)
fit <- nls(y~A*(1-exp(-b*x))+R, data=df, start=list(A=3,b=0.005,R=-2))
s <- summary(fit)
A <- s[["parameters"]][1]
b <- s[["parameters"]][2]
R <- s[["parameters"]][3]
f <- function(z){
v <- A*(1-exp(-b*z))+R
v
}
x.t <- 0:max(x)
y.c <- sapply(x.t, f)
lines(x.t, y.c, col='red')
print(s)
答案 2 :(得分:0)
计算机按照你的说法行事:
y~A(1-exp(-bx))+R
此处R将A(...)
解释为函数,将bx
解释为变量。
您想要y~A*(1-exp(-b*x))+R
。