WinBUGS代码出错

时间:2013-01-22 19:20:46

标签: r bayesian winbugs

我无法获得下面的WinBUGS代码。它适用于普通的先验,但不适用于均匀的先验。点击compile后显示的错误消息为array index is greater than array upper bound for age。那是什么意思?可以请任何人帮我处理下面的代码吗?

model
{
for (i in 1:n) {
# Linear regression on logit
logit(p[i]) <- alpha + b.sex*sex[i] + b.age*age[i]
# Likelihood function for each data point
frac[i] ~ dbern(p[i])
}
alpha ~ dunif(0, 1) # Prior for intercept
b.sex ~ dunif(0, 1) # Prior for slope of sex
b.age ~ dunif(0, 1) # Prior for slope of age
}
Data
list(sex=c(1, 1, 1, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 1, 1, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 1, 1, 0, 0,     1,
1, 0, 1, 1, 1, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 1, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 1, 1,     1, 0,
0, 1, 1, 1, 1, 0, 0, 0, 1, 1, 1, 0, 0, 1, 1, 1, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 1,      1, 1,
0, 1, 0, 1, 1, 1, 0, 1, 1, 1, 1, 1),
age= c(69, 57, 61, 60, 69, 74, 63, 68, 64, 53, 60, 58, 79, 56, 53, 74, 56, 76, 72,
56, 66, 52, 77, 70, 69, 76, 72, 53, 69, 59, 73, 77, 55, 77, 68, 62, 56, 68, 70, 60,
57, 51, 51, 63, 57, 80, 52, 65, 72, 80, 73, 76, 79, 66, 51, 76, 75, 66, 75, 78, 70,
67, 51, 70, 71, 71, 74, 74, 60, 58, 55, 61, 65, 52, 68, 75, 52, 53, 70),
frac=c(1, 1, 1, 0, 1, 1, 0, 1, 1, 0, 1, 0, 1, 1, 0, 1, 0, 1, 1, 0, 1, 0, 1, 1, 1, 1, 1,        0,
1, 0, 1, 1, 0, 1, 1, 1, 0, 1, 1, 0, 1, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 1, 1, 1, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 1,        1, 1,
1, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 1, 1, 1, 1, 1, 0, 0, 1, 1, 0, 1, 1, 1, 0, 0, 1, 1, 1, 1,      1, 1,
1, 0, 1, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 1),
n=100)
Initial Values
list(alpha=0.5, b.sex=0.5, b.age=0.5)

1 个答案:

答案 0 :(得分:5)

哦,那很清楚。 WinBUGS说array index is greater than array upper bound for age。 这清楚地暗示了一个错误 - &gt;我看到你有n = 100age列表不够长:

> your_list <- list(...)
> str(your_list)
List of 4
 $ sex : num [1:100] 1 1 1 0 1 1 0 0 0 0 ...
 $ age : num [1:79] 69 57 61 60 69 74 63 68 64 53 ...
 $ frac: num [1:100] 1 1 1 0 1 1 0 1 1 0 ...
 $ n   : num 100

无论如何,我不会在此之前使用制服;除非你真的知道你在做什么,否则我会推荐平常,比如dnorm(0, 1.0E-10)左右。您还应该允许系数的负值。 “零假设”通常是系数为零,因此对于系数后验分布的平均值为零,你应该“允许它从两侧留出一些空间”(直观地说)。