checkForRemoteErrors中的R Snow错误(lapply(cl,recvResult)):一个节点产生错误:无法打开连接

时间:2013-01-22 15:50:53

标签: r lapply

我在三个主机集群上使用SNOW有几个月的成功经验,我在其中使用clusterEvalQ(cl,source('blah'))来获取专有函数。旧的源代码工作正常。在添加新功能时,我创建了新的专有方法文件,发现一些文件无法从master获取。我所知道的文件之间的唯一区别是文件名。是否有可能某些文件名有效,有些则不然?您是否知道确定实际失败的方法,以便找到解决方法?

utils_grid.r是使用cp命令从ta.r创建的。 “ta.r”有效,“utils_grid.r”没有。

$ diff utils_grid.r ta.r $

  

-rwxrwxrwx。 1 tim开发人员6.2K 1月22日10:12 utils_grid.r *   -rwxrwxrwx。 1 tim开发人员6.2K Sep 12 14:06 ta.r *

clusterEvalQ(cl,source(file="/home/mslade/exp/trunk/R/rsrc/AlphaRex/utils_grid.r"))
  

checkForRemoteErrors(lapply(cl,recvResult))中的错误:一个节点   产生错误:无法打开连接

clusterEvalQ(cl,source("/home/mslade/exp/trunk/R/rsrc/AlphaRex/ta.r",verbose=F,echo=T))
  

[[1]] [[1]] $ value函数(data,topn = 1,keepn = 1,dirMaxMin =   TRUE){       temp = coredata(数据)       for(i in 1:nrow(temp)){           x = temp [i,]           o = sort.list(x,na.last = TRUE,减少= dirMaxMin)           index =哪个(!is.na(x))           x [] = NA           if(len(index)> 0){               n = min(topn,len(index))               x [o [1:n]] = 1               if(i> = 2){。 。 。 (余下省略)

     

R version 2.15.0(2012-03-30)平台:x86_64-redhat-linux-gnu   (64位)

     

区域设置:[1] LC_CTYPE = en_US.UTF-8 LC_NUMERIC = C
  LC_TIME = en_US.UTF-8 LC_COLLATE = en_US.UTF-8
  LC_MONETARY = en_US.UTF-8 LC_MESSAGES = en_US.UTF-8 [7] LC_PAPER = C   LC_NAME = C LC_ADDRESS = C LC_TELEPHONE = C
  LC_MEASUREMENT = en_US.UTF-8 LC_IDENTIFICATION = C

     

附加基础包:[1] splines stats graphics grDevices   utils datasets方法库

     

其他附件包:[1] lmtest_0.9-30 abind_1.4-0
  snow_0.3-9 tseries_0.10-28 quadprog_1.5-4 ipred_0.8-13   prodlim_1.3.1 KernSmooth_2.23-7 [9] nnet_7.3-1
  mlbench_2.1-0 MASS_7.3-17 randomForest_4.6-6 ellipse_0.3-7   mclust_3.4.11 pvclust_1.2-2 maptree_1.4-6 [17]   rpart_3.1-52 class_7.3-3 cluster_1.14.2 RTAQ_0.2
  timeDate_2160.97 Hmisc_3.9-3 survival_2.36-12
  lattice_0.20-6 [25] Romd_0.1.15 statUtils_0.1.8
  Rcpp_0.9.10 quantmod_0.3-17 TTR_0.21-1
  Defaults_1.1-1 xts_0.8-6 hydroGOF_0.3-4 [33]   zoo_1.7-7 MethComp_1.15 nlme_3.1-103
  SDMTools_1.1-12 rmongodb_1.0.3 RMongo_0.0.21 RUnit_0.4.26   rJava_0.9-3 [41] xtable_1.7-0 moments_0.13
  gtools_2.6.2 rjson_0.2.8 RMySQL_0.9-3 DBI_0.2-5
  RODBC_1.3-5

     

通过命名空间加载(而不是附加):[1] automap_1.0-12   e1071_1.6 grid_2.15.0 gstat_1.0-13 hydroTSM_0.3-5 sp_0.9-99   tools_2.15.0

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