Question

我遇到了'raster'包的'plot'功能的奇怪问题。

library(raster)
ras <- raster(ncol=10, nrow=10)

修改

values(ras) <- runif(ncell(ras))

结束编辑

plot(ras)

Erreur dans as.double(y) : 
cannot coerce type 'S4' to vector of type 'double'

对于我在网上看到的内容，此错误取决于用户，可能取决于加载的包。在我的例子中，问题来自于r使用'graphics'包中的标准'plot'方法，因为它应该使用特定的'raster'方法，因为'ras'是一个rasterLayer对象。但是，由于我不理解的原因，'plot'不会导入'raster'命名空间，而所有其他功能都是。

> raster::plot
Erreur : 'plot' n'est pas un objet exporté depuis 'namespace:raster'

与之比较：

raster::persp
standardGeneric for "persp" defined from package "graphics"
function (x, ...) 
standardGeneric("persp")
<environment: 0x0cd9eb80>
Methods may be defined for arguments: x
Use  showMethods("persp")  for currently available ones.

由于我不完全了解命名空间的行为，我正在寻找你的帮助！这种情况对你来说是否熟悉，你有办法解决吗？在此期间，您是否知道显示命名空间内容的函数（因此我可以逐步检查栅格命名空间的内容）？

PS：我正在使用带有RStudio的R 2.15.2，加载了很多软件包，但都是最新的。

sessionInfo()
R version 2.15.0 (2012-03-30)
Platform: i386-pc-mingw32/i386 (32-bit)

locale:
[1] LC_COLLATE=French_Belgium.1252  LC_CTYPE=French_Belgium.1252          LC_MONETARY=French_Belgium.1252 LC_NUMERIC=C                   
[5] LC_TIME=French_Belgium.1252    

attached base packages:
[1] stats     graphics  grDevices utils     datasets  methods   base     

other attached packages:
[1] raster_2.0-41 sp_1.0-5     

loaded via a namespace (and not attached):
 [1] grid_2.15.0      hexbin_1.26.0    intervals_0.13.3 lattice_0.20-6   rgdal_0.8-4      spacetime_1.0-3  spam_0.29-2      tools_2.15.0    
 [9] xts_0.9-2        zoo_1.7-9

谢谢你，

弗朗索瓦

Answer 1

使用它可以获得包栅格的所有对象列表

basevals <- ls(pos="package:raster")

例如

   which(basevals == 'persp')  ## function persp shows up because it is the exported generic.
   141
   which(basevals == 'plot')   ## no function plot
   integer(0)

不，当我这样做时，它对我有用：

library(raster)
r <- raster(ncol=10, nrow=10)
values(r) <- runif(ncell(r))
plot(r, main='Raster with 100 cells')

所以这里肯定有一种情节方法。它不是在前面的列表“basevals”中，因为它是一种S4方法。

要获得光栅包的绘图方法，请尝试以下方法：

 getMethod('plot',signature=signature(x='Raster', y='ANY'))

或更有效地使用

findMethods("plot", "package:raster").

Answer 2

当你有一个过时的会话（通常是在启动时加载一个旧会话引起）时，有时会发生这种情况，如果你开始一个新的R会话（没有加载以前保存的会话）就会消失。

Answer 3

我遇到了同样的问题并重新安装了光栅包修复它。

install.packages("raster")

Answer 4

对我来说，解决这个S4类命名空间问题的原因是将raster包添加为依赖关系。因此，使用attach()函数也应该起作用，因为这是依赖关系所做的。我知道这不是一个理想的解决方案，但是嘿，它是一种统计语言;）

Answer 5

我一直在运行同样的错误，也使用了RStudio。

我的问题是我在项目的raster文件中通过library(raster)加载了.Rprofile个包。但是Rprofile中的代码会在其他任何内容之前加载，因此graphics包（包含绘图通用）会在栅格之后加载，从而导致问题。

解决方案：将library(graphics)放在Rprofile的library(raster)之前，这对我有用。

带有栅格包绘图功能的命名空间问题？

5 个答案: