假设我有以下矩阵:
矩阵可以分解成块,这样每个块必须具有相同的列数,其中该行的值被标记为true。
例如,以下块有效:
这意味着行不必是连续的。
列也不必是连续的,因为以下是有效的块:
但是,以下内容无效:
那就是说,什么算法可用于选择块,以便在找到所有块时使用最少数量的块?
鉴于上面的示例,正确的解决方案是(具有相同颜色的项目代表有效的块):
在上面的示例中,三个是可以分解为最小数量的块。
请注意,以下内容也是有效的解决方案:
对于解决方案没有偏好,实际上,只是为了获得最少数量的块。
我想过使用相邻单元格进行计数,但这并不能解释列值不必是连续的事实。
我认为关键在于找到具有约束条件的最大区域的块,删除这些项目,然后重复。
采用这种方法,解决方案是:
但是如何遍历矩阵并找到最大的区域是我的目的。
另请注意,如果您想在操作期间重新洗牌行和/或列,这是一个有效的操作(为了找到最大的区域),但我想你只能在删除后才能这样做矩阵中最大的区域(在找到一个区域并移动到下一个区域之后)。
答案 0 :(得分:2)
你在真相表上正在做circuit minimization。对于4x4真值表,您可以使用K map。 Quine-McCluskey algorithm是一种可以处理更大真值表的概括。
请记住,问题是NP-Hard,因此根据真值表的大小,这个问题可能会迅速增加到难以处理的大小。
答案 1 :(得分:0)
我提出的解决方案相当简单,但非常耗时。
它可以分为4个主要步骤:
首先,下面的算法适用于列或行主矩阵。我选择了列进行解释,但只要在整个过程中保持一致,您可以在方便时将其换成行。
答案中的示例代码在OCaml中,但不使用该语言的任何特定功能,因此应该很容易移植到其他ML方言。
每列可以看作是一个位向量。观察一个模式(你在问题中称为块)可以通过交叉(即和)所有列,或构成它的所有行,甚至组合来构造。因此,第一步实际上是生成行和列的所有组合(矩阵的行和列的powerset,如果你愿意),同时交叉它们,并过滤掉重复项。
我们考虑矩阵数据类型的以下接口:
module type MATRIX = sig
type t
val w : int (* the width of the matrix *)
val h : int (* the height ........ *)
val get : t -> int -> int -> bool (* cell value getter *)
end
现在让我们来看看这一步的代码:
let clength = M.h
let rlength = M.w
(* the vector datatype used throughought the algorithm
operator on this type are in the module V *)
type vector = V.t
(* a pattern description and comparison operators *)
module Pattern = struct
type t = {
w : int; (* width of thd pattern *)
h : int; (* height of the pattern *)
rows : vector; (* which rows of the matrix are used *)
cols : vector; (* which columns... *)
}
let compare a b = Pervasives.compare a b
let equal a b = compare a b = 0
end
(* pattern set : let us store patterns without duplicates *)
module PS = Set.Make(Pattern)
(* a simple recursive loop on @f @k times *)
let rec fold f acc k =
if k < 0
then acc
else fold f (f acc k) (pred k)
(* extract a column/row of the given matrix *)
let cr_extract mget len =
fold (fun v j -> if mget j then V.set v j else v) (V.null len) (pred len)
let col_extract m i = cr_extract (fun j -> M.get m i j) clength
let row_extract m i = cr_extract (fun j -> M.get m j i) rlength
(* encode a single column as a pattern *)
let col_encode c i =
{ w = 1; h = count c; rows = V.set (V.null clength) i; cols = c }
let row_encode r i =
{ h = 1; w = count r; cols = V.set (V.null rlength) i; rows = r }
(* try to add a column to a pattern *)
let col_intersect p c i =
let col = V.l_and p.cols c in
let h = V.count col in
if h > 0
then
let row = V.set (V.copy p.rows) i in
Some {w = V.count row; h = h; rows = row; clos = col}
else None
let row_intersect p r i =
let row = V.l_and p.rows r in
let w = V.count row in
if w > 0
then
let col = V.set (V.copy p.cols) i in
Some { w = w; h = V.count col; rows = row; cols = col }
else None
let build_patterns m =
let bp k ps extract encode intersect =
let build (l,k) =
let c = extract m k in
let u = encode c k in
let fld p ps =
match intersect p c k with
None -> l
| Some npc -> PS.add npc ps
in
PS.fold fld (PS.add u q) q, succ k
in
fst (fold (fun res _ -> build res) (ps, 0) k)
in
let ps = bp (pred rlength) PS.empty col_extract col_encode col_intersect in
let ps = bp (pred clength) ps row_extract row_encode row_intersect in
PS.elements ps
V模块必须符合整个算法的以下签名:
module type V = sig
type t
val null : int -> t (* the null vector, ie. with all entries equal to false *)
val copy : t -> t (* copy operator *)
val get : t -> int -> bool (* get the nth element *)
val set : t -> int -> t (* set the nth element to true *)
val l_and : t -> t -> t (* intersection operator, ie. logical and *)
val l_or : t -> t -> t (* logical or *)
val count : t -> int (* number of elements set to true *)
val equal : t -> t -> bool (* equality predicate *)
end
组合模式也可以看作是一个powerset结构,但有一些限制:有效的模式集可能只包含不重叠的模式。如果两个模式都包含至少一个公共矩阵单元,则后者可以被定义为真。 使用上面使用的模式数据结构,重叠谓词非常简单:
let overlap p1 p2 =
let nullc = V.null h
and nullr = V.null w in
let o v1 v2 n = not (V.equal (V.l_and v1 v2) n) in
o p1.rows p2.rows nullr && o p1.cols p2.cols nullc
模式记录的cols
和rows
表示矩阵中的哪些坐标包含在模式中。因此,两个字段上的逻辑和将告诉我们模式是否重叠。
为了在模式集中包含模式,我们必须确保它不与模式的任何模式重叠。
type pset = {
n : int; (* number of patterns in the set *)
pats : pattern list;
}
let overlap sp p =
List.exists (fun x -> overlap x p) sp.pats
let scombine sp p =
if overlap sp p
then None
else Some {
n = sp.n + 1;
pats = p::sp.pats;
}
let build_pattern_sets l =
let pset l p =
let sp = { n = 1; pats = [p] } in
List.fold_left (fun l spx ->
match scombine spx p with
None -> l
| Some nsp -> nsp::l
) (sp::l) l
in List.fold_left pset [] l
此步骤会产生大量集合,因此非常耗费内存和计算量。这当然是这个解决方案的弱点,但我还没有看到如何减少折叠。
如果用它重建矩阵时,模式集是不完整的,我们不会获得原始模式。所以这个过程很简单。
let build_matrix ps w =
let add m p =
let rec add_col p i = function
| [] -> []
| c::cs ->
let c =
if V.get p.rows i
then V.l_or c p.cols
else c
in c::(add_col p (succ i) cs)
in add_col p 0 m
in
(* null matrix as a list of null vectors *)
let m = fold (fun l _ -> V.null clength::l) [] (pred rlength) in
List.fold_left add m ps.pats
let drop_incomplete_sets m l =
(* convert the matrix to a list of columns *)
let m' = fold (fun l k -> col_extract m k ::l) [] (pred rlength) in
let complete m sp =
let m' = build_matrix sp in
m = m'
in List.filter (fun x -> complete m' x) l
最后一步是选择元素数量最少的集合:
let smallest_set l =
let smallest ps1 ps2 = if ps1.n < ps2.n then ps1 else ps2 in
match l with
| [] -> assert false (* there should be at least 1 solution *)
| h::t -> List.fold_left smallest h t
然后整个计算只是每个步骤的链接:
let compute m =
let (|>) f g = g f in
build_patterns m |> build_pattern_sets |> drop_incomplete_sets m |> smallest_set
上面的算法构造了一个powerset的powerset,并进行了一些有限的过滤。据我所知,还没有一种减少搜索的方法(如评论中提到的,如果这是一个NP难题,那就没有了)。
此算法检查所有可能的解决方案,并正确返回最佳解决方案(使用多个矩阵进行测试,包括问题描述中给出的矩阵。
关于您在问题中提出的启发式的一个简短评论:
可以使用第一步轻松实现,删除找到的最大模式,然后递归。那会比我的算法更快地提出一个解决方案。但是,找到的解决方案可能不是最佳的。
例如,请考虑以下矩阵:
.x...
.xxx
xxx.
...x.
中央4细胞块是最大的可以找到的,但使用它的集合总共包含5个模式。
.1...
.223
422.
...5.
然而,此解决方案仅使用4:
.1...
.122
334.
...4.
链接到我为此答案撰写的full code。
答案 2 :(得分:0)
这个问题与Biclustering密切相关,其中有许多有效的算法(以及免费提供的实现)。通常,您必须指定您希望找到的群集K
的数量;如果您不清楚K
应该是什么,可以在K
上进行二进制搜索。
如果双聚类没有重叠,你就完成了,否则你需要做一些几何体来将它们切成“块”。