读取包含不完整标题的CSV文件

时间:2013-01-17 09:19:30

标签: python parsing csv dialect

之前我没有使用csv module中的python,但它似乎是一个很好的工具,可以满足我的需求。

我面临的问题是我的csv-file看起来有点奇怪。 (起初很难注意到)

请参阅下面的示例,我的意思是:

A|B|C|D|x|F|G|x|H
1||2||3|4||5|6
1||2||3|4||5|6
1||2||3|4||5|6
1||2||3|4||5|6

上面有一些索引(例如 column-x )应该读作 Dx Gx D-column G-column 则为空列。

所以我需要的是,当csv处理标题时,它应该创建像 Dx Gx 这样的标题,而忽略 D G 列并取代 x-column 中的值。

(我尝试使用以下代码首先读取文件并对其进行后期处理,但由于列名 x 始终相同,并且csv.DictReader,因此无法进行处理。似乎丢弃重复的列名称

with open('myCSV.log') as csvFile:
    reader = csv.DictReader(csvFile, dialect='pipes')
    for row in reader:
        print row

这可以通过dialect或其他一些配置csv-module的奇特方式实现,还是我必须自己解析?

4 个答案:

答案 0 :(得分:1)

使用pandas

import pandas as pd
print pd.read_csv('test.csv',sep='|')

出:

   A   B  C   D  x  F   G  x.1  H
0  1 NaN  2 NaN  3  4 NaN    5  6
1  1 NaN  2 NaN  3  4 NaN    5  6
2  1 NaN  2 NaN  3  4 NaN    5  6
3  1 NaN  2 NaN  3  4 NaN    5  6

如果需要,可以使用to_dict()方法将其转换为dict:

{'A': {0: 1, 1: 1, 2: 1, 3: 1},
 'B': {0: nan, 1: nan, 2: nan, 3: nan},
 'C': {0: 2, 1: 2, 2: 2, 3: 2},
 'D': {0: nan, 1: nan, 2: nan, 3: nan},
 'F': {0: 4, 1: 4, 2: 4, 3: 4},
 'G': {0: nan, 1: nan, 2: nan, 3: nan},
 'H': {0: 6, 1: 6, 2: 6, 3: 6},
 'x': {0: 3, 1: 3, 2: 3, 3: 3},
 'x.1': {0: 5, 1: 5, 2: 5, 3: 5}}

编辑: 如果您需要列的某些名称,您可以这样做:

import pandas as pd
df = pd.read_csv('test.csv',sep='|')
df.columns = [df.columns[index-1]+'x' if 'x' in name 
              else name for index,name in enumerate(df.columns)]
print df

   A   B  C   D  Dx  F   G  Gx  H
0  1 NaN  2 NaN   3  4 NaN   5  6
1  1 NaN  2 NaN   3  4 NaN   5  6
2  1 NaN  2 NaN   3  4 NaN   5  6
3  1 NaN  2 NaN   3  4 NaN   5  6

如果你想丢失空cols:

print df.dropna(axis=1,how='all')

   A  C  Dx  F  Gx  H
0  1  2   3  4   5  6
1  1  2   3  4   5  6
2  1  2   3  4   5  6
3  1  2   3  4   5  6

答案 1 :(得分:0)

我认为阅读文件并对其进行后期处理确实是要走的路。只是不要使用DictReader

with open('myCSV.log') as csvFile:
    for row in csv.reader(csvFile, delimiter='|'):
        print row


['A', 'B', 'C', 'D', 'x', 'F', 'G', 'x', 'H']
['1', '', '2', '', '3', '4', '', '5', '6']
['1', '', '2', '', '3', '4', '', '5', '6']
['1', '', '2', '', '3', '4', '', '5', '6']
['1', '', '2', '', '3', '4', '', '5', '6']

答案 2 :(得分:0)

你有9个标题和9个列,除了加倍的列标题之外,我没有看到.csv的问题。您可以覆盖DictReader中的字段名,以重命名这些字段。此外,如果要将列“D”重命名为“Dx”,可以使用此参数完成。 。

import csv
from pprint import pprint
with open('testfile.csv') as csvFile:
reader = csv.DictReader(csvFile, fieldnames = ['A','B','C','meh','Dx','F','moe','Gx','H'], delimiter = '|'  )
for row in reader:
        pprint(row)

这里使用方言似乎没有必要在这里!这是我的testoutput,第一行现在是标题。

{'A': 'A',
 'B': 'B',
 'C': 'C',
 'Dx': 'x',
 'F': 'F',
 'Gx': 'x',
 'H': 'H',
 'meh': 'D',
 'moe': 'G'}
{'A': '1',
 'B': '',
 'C': '2',
 'Dx': '3',
 'F': '4',
 'Gx': '5',
 'H': '6',
 'meh': '',
 'moe': ''}
 ....

答案 3 :(得分:0)

from StringIO import StringIO
import csv

with open('test.csv') as f:
    lines = f.read().split('\n')
    line_0 = lines[0].split('|')
    lines[0] = '|'.join(line_0[i-1] if 'x' in n else n for i,n in 
                                               enumerate(line_0))

    reader = csv.DictReader(StringIO('\n'.join(lines)),delimiter = '|' )
    for row in reader:
        print row

出:

{'A': '1', 'C': '2', 'B': '', 'D': '3', 'G': '5', 'F': '4', 'H': '6'}
{'A': '1', 'C': '2', 'B': '', 'D': '3', 'G': '5', 'F': '4', 'H': '6'}
{'A': '1', 'C': '2', 'B': '', 'D': '3', 'G': '5', 'F': '4', 'H': '6'}
{'A': '1', 'C': '2', 'B': '', 'D': '3', 'G': '5', 'F': '4', 'H': '6'}