我有一段很长的继承的FORTRAN77代码,我使用.Fortran()
从R调用。 Fortran代码包含一组子例程,当嵌入到Fortran程序中并随后从命令行编译和运行时可以工作。但是,当我从R调用它时,它第二次调用函数时会崩溃R.
由于Fortran代码使用大量索引和数组维度存储为变量,因此我认为存在问题。在某些时候,Fortran代码正在寻找内存中不应该存在的位置。因此,我需要逐步检查Fortran代码,检查是否所有来自R的内容都是我认为的,并且代码执行我认为它的功能。
如果它是一个R函数,我可以选择使用debug()
,添加browser()
语句并打印出我想在代码中的某个点看到的任何值。但Fortran代码不允许任何这些事情发生。如果我理解正确,则R不会捕获Fortran的屏幕输出。
所以有人知道我究竟能检查R传递给Fortran代码的参数的类型和值。如果你可以解释一下我从R调用后如何调试该代码,那将是非常出色的。
这是一个说明我的意思的例子。
C An example program
C
PROGRAM EXAMPLE
INTEGER N
PARAMETER (N=10)
REAL X0, X(N),MEAN
C
X0 = 14
DO 10 I = 1,10
FI = FLOAT(I)
X(I) = X0 + FI
10 CONTINUE
CALL MYSUB(X0,MEAN)
END
C
C Mysub the subroutine
C
SUBROUTINE MYSUB(X,N,MEAN)
INTEGER N
REAL X(N), MEAN
MEAN = 0
DO 20 I = 1,N
MEAN = MEAN + X(I)
20 CONTINUE
MEAN = MEAN / N
RETURN
END
说我想从R调用子程序mysub,我想确保正确地得到X和N.我使用以下功能:
mysub <- function(x){
if(!is.vector(x) | is.numeric(x)) stop("X has to be a numeric vector")
n <- length(x)
res <- .Fortran('mysub',X=as.single(x), N=as.integer(n), MEAN=single(1))
return(res$MEAN)
}
答案 0 :(得分:4)
在你的示例程序中,只用2个参数调用MYSUB,而不是MYSUB定义中的3个参数:(X,N,MEAN)
这可能与你的问题无关,但既然你问的是调试FORTRAN和参数,我想我应该指出来。 FORTRAN子程序是独立的编译。没有什么可以阻止您传递错误数量的参数(没有编译器错误或链接提示),这可能会导致问题。