渐变阴影置信区间

时间:2013-01-15 16:19:37

标签: r graph ggplot2

我想即兴表达与密度成正比的回归阴影。例如,置信区间较窄,阴影密集,而如果置信区间宽,则填充颜色较浅。结果图可能如下所示:

enter image description here

以下是一个工作示例:

set.seed(1234)
md <- c(seq(0.01, 1, 0.01), rev(seq(0.01, 1, 0.01)))
cv <-  c(rev(seq(0.01, 1, 0.01)), seq(0.01, 1, 0.01))
rv <- rnorm (length(md), 0.1, 0.05)

 df <- data.frame(x =1:length(md),  F = md*2.5 + rv, L =md*2.5 -rv-cv, U =md*2.5+ rv+ cv)
 plot(df$x, df$F, ylim = c(0,4), type = "l")

 polygon(c(df$x,rev(df$x)),c(df$L,rev(df$U)),col = "cadetblue", border = FALSE)
 lines(df$x, df$F, lwd = 2)
 #add red lines on borders of polygon
 lines(df$x, df$U, col="red",lty=2)
 lines(df$x, df$L, col="red",lty=2)

1 个答案:

答案 0 :(得分:7)

densregion()包中的denstrip命令似乎可以执行您想要的操作。在其帮助页面中对示例进行了一些调整:

require(denstrip)
x <- 1:10
nx <- length(x)
est <- seq(0, 1, length=nx)^3
se <- seq(.7,1.3,length.out=nx)/qnorm(0.975)
y <- seq(-3, 3, length=100)
z <- matrix(nrow=nx, ncol=length(y))
for(i in 1:nx) z[i,] <- dnorm(y, est[i], se[i])
plot(x, type="n", ylim=c(-3, 3),xlab="")
densregion(x, y, z)
lines(x,est,col="white")

enter image description here