Question

我正在尝试制作项目polyworld，但在编译qt_clust.o时收到错误

g++ -o bin/qt_clust .bld/qt_clust/tools/clustering/qt_clust.o -L/usr/lib -L/usr/local/lib -L/usr/include -lz -lgsl -lgslcblas -lgomp

并获取

"_alloca", referenced from:
      __Z38find_valid_neighbors__measureNeighborsP7ClusterRSt6vectorIiSaIiEEP22GeneDistanceDeltaCacheP19PopulationPartition.omp_fn.4 in qt_clust.o
     (maybe you meant: ParsedCluster* std::vector<ParsedCluster, std::allocator<ParsedCluster> >::_M_allocate_and_copy<__gnu_cxx::__normal_iterator<ParsedCluster const*, std::vector<ParsedCluster, std::allocator<ParsedCluster> > > >(unsigned long, __gnu_cxx::__normal_iterator<ParsedCluster const*, std::vector<ParsedCluster, std::allocator<ParsedCluster> > >, __gnu_cxx::__normal_iterator<ParsedCluster const*, std::vector<ParsedCluster, std::allocator<ParsedCluster> > >))
ld: symbol(s) not found for architecture x86_64
collect2: ld returned 1 exit status

我很确定此文件存在问题：https://github.com/JaimieMurdock/polyworld/blob/master/tools/clustering/qt_clust.cpp

我在OSX Mountain Lion上。

Answer 1

如果您更改了这些行：

    float dists[clusterNeighborCandidates.size() - (i+1)];

    compute_distances( distance_deltaCache,
                       neighborPartition->genomeCache,
                       clusterNeighborCandidates,
                       i, i+1, clusterNeighborCandidates.size(),
                       dists );

到此：

    ::std::vector<float> dists(clusterNeighborCandidates.size() - (i+1));

    compute_distances( distance_deltaCache,
                       neighborPartition->genomeCache,
                       clusterNeighborCandidates,
                       i, i+1, clusterNeighborCandidates.size(),
                       &(dists[0]) );

我打赌问题会消失。

问题是原始代码在堆栈上有一个动态大小的数组。编译器生成的代码调用'alloca'来从堆栈中分配内存。不幸的是，这个功能是非标准的，并且一般都有一些阴暗的历史。

动态大小的数组，而合法的C99，不是合法的C ++ 03或C ++ 11。我认为g ++和clang都支持它们作为扩展。但显然OS X下的支持略有不足。

::std::vector巧妙地回避了这个问题。它不会在堆栈上分配数组。它在堆上分配它。

架构x86_64的未定义符号：“_ alloca”

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