合并行中不相交且包含NA的数据帧中的行

时间:2013-01-10 22:58:06

标签: r dataframe dplyr data.table coalesce

我有一个包含两行的数据框:

| code | name  | v1 | v2 | v3 | v4 |
|------|-------|----|----|----|----|
| 345  | Yemen | NA | 2  | 3  | NA |
| 346  | Yemen | 4  | NA | NA | 5  |

有没有简单的方法来合并这两行? 如果我在“346”中重命名“345”会怎样?这会让事情变得更容易吗?

2 个答案:

答案 0 :(得分:10)

您可以使用aggregate。假设您要在列name中合并具有相同值的行:

aggregate(x=DF[c("v1","v2","v3","v4")], by=list(name=DF$name), min, na.rm = TRUE)
   name v1 v2 v3 v4
1 Yemen  4  2  3  5

这就像SQL SELECT name, min(v1) GROUP BY namemin函数是任意的,您也可以使用maxmean,所有这些函数都会返回NA中的非NA值,如果na.rm = TRUE则返回非NA值。 (如果存在于R中,类似SQL的coalesce()函数听起来会更好。)

但是,您应首先检查给定name的所有非NA值是否相同。例如,使用aggregatemin运行max并进行比较,或者使用range运行。

最后,如果您有比v1-4更多的变量,可以使用DF[,!(names(DF) %in% c("code","name"))]来定义列。

答案 1 :(得分:2)

添加dplyrdata.table解决方案以提高完整性

使用dplyr::coalesce()

library(dplyr)

sum_NA <- function(x) {if (all(is.na(x))) x[NA_integer_] else sum(x, na.rm = TRUE)}

df %>% 
  group_by(name) %>% 
  summarise_all(sum_NA)
#> # A tibble: 1 x 6
#>   name   code    v1    v2    v3    v4
#>   <fct> <dbl> <dbl> <dbl> <dbl> <dbl>
#> 1 Yemen   691     4     2     3     5

# Ref: https://stackoverflow.com/a/45515491
# Supply lists by splicing them into dots:
coalesce_by_column <- function(df) {
  return(dplyr::coalesce(!!! as.list(df)))
}

df %>% 
  group_by(name) %>% 
  summarise_all(coalesce_by_column)
#> # A tibble: 1 x 6
#>   name   code    v1    v2    v3    v4
#>   <fct> <dbl> <dbl> <dbl> <dbl> <dbl>
#> 1 Yemen   345     4     2     3     5

使用data.table

# Ref: https://stackoverflow.com/q/28036294/
library(data.table)
setDT(df)[, lapply(.SD, na.omit), by = name]
#>     name code v1 v2 v3 v4
#> 1: Yemen  345  4  2  3  5
#> 2: Yemen  346  4  2  3  5

setDT(df)[, code := NULL][, lapply(.SD, na.omit), by = name]    
#>     name v1 v2 v3 v4
#> 1: Yemen  4  2  3  5

setDT(df)[, code := NULL][, lapply(.SD, sum_NA), by = name]
#>     name v1 v2 v3 v4
#> 1: Yemen  4  2  3  5