data.table中的“by”(分组) - 我错过了什么?

时间:2013-01-10 20:11:56

标签: r data.table

我正在处理一个大数据。并使用'by'来'分组'3个变量。

我的data.table是d并且键为“ma”(10位整数,但我在下面缩短了它。)

但是设置by="ma,year,month"(对我而言,更直观的分组语句)并没有给出我想要的东西。例如,ma = 284有2011年11月的3个条目,或ma = 672有2011年12月的2个条目。

> d[,list(n=length(trx_num)),by=list(ma,year,month)]
      ma year month n
  1: 284 2011    12 3
  2: 284 2012     1 1
  3: 284 2011    11 5
  4: 284 2011    11 1
  5: 284 2011    11 2
 ---
5782971: 672 2012     7 1
5782972: 672 2011    12 1
5782973: 672 2012     2 1
5782974: 672 2011    12 1
5782975: 672 2012     1 1

然而,反转'by'顺序会产生所需的结果。

> d[,list(n=length(trx_num)),by=list(month,year,ma)]
     month year ma  n
  1:    12 2011 284  3
  2:     1 2012 284  1
  3:    11 2011 284  8
  4:     5 2012 543  7
  5:     7 2012 543  3
 ---
1214686:     5 2012 672 28
1214687:     4 2012 672 13
1214688:    12 2011 672 11
1214689:     7 2012 672  9
1214690:     9 2012 672 11

我在这里缺少什么?提前致谢。

编辑:

str()给出错误结果的数据

> str(d)
Classes âdata.tableâ and 'data.frame':  14688135 obs. of  3 variables:
 $ ma   : num  3e+10 3e+10 3e+10 3e+10 3e+10 ...
 $ year : int  2011 2012 2011 2011 2011 2011 2011 2011 2011 2011 ...
 $ month: int  12 1 11 12 11 11 11 11 11 11 ...
 - attr(*, ".internal.selfref")=<externalptr>
 - attr(*, "sorted")= chr "ma"

错误结果的str():

> str(d[,.N,by=list(ma,year,month)])
Classes âdata.tableâ and 'data.frame':  5782975 obs. of  4 variables:
 $ ma   : num  3e+10 3e+10 3e+10 3e+10 3e+10 ...
 $ year : int  2011 2012 2011 2011 2011 2012 2012 2012 2012 2012 ...
 $ month: int  12 1 11 11 11 5 7 6 9 8 ...
 $ N    : int  3 1 5 1 2 1 1 1 1 1 ...
 - attr(*, ".internal.selfref")=<externalptr>

正确结果的str():

> str(d[,.N,by=list(month,year,ma)])
Classes âdata.tableâ and 'data.frame':  1214690 obs. of  4 variables:
 $ month: int  12 1 11 5 7 6 9 8 11 12 ...
 $ year : int  2011 2012 2011 2012 2012 2012 2012 2012 2011 2011 ...
 $ ma   : num  3e+10 3e+10 3e+10 3e+10 3e+10 ...
 $ N    : int  3 1 8 7 3 12 15 3 6 6 ...
 - attr(*, ".internal.selfref")=<externalptr>

2 个答案:

答案 0 :(得分:7)

要结束评论跟踪,ma列的类型为numeric并包含精确不同但非常接近的值,几乎在机器容差范围内但不完全相同。换句话说,这种情况:

 x < y < z
 (y-x) just less than machine tolerance so considered equal
 (z-y) just less than machine tolerance so considered equal
 (z-x) just over machine tolerance so considered not equal

当这样的列与另外两列(即by= 3列)分组时,这些列的顺序(如果其中一列具有上述值)可以更改这些值是否被视为相等(和/或在同一组)。

解决方案是不要为此类数据使用类型numericdouble是另一个名称)。使用integer,或者在这种情况下,整数大于2 ^ 31(导致强制到double并且失去准确性,iiuc),characterdata.table快速排序integercharacter。无论如何,它在排序double方面的速度并不快。

我们会尝试向warning添加新的data.table

FR#2469 Add new tolerance.warning option to detect and issue warning if any numeric values are close but not quite within machine tolerance

答案 1 :(得分:1)

我构建了一个小测试用例,在这个对话框中的一个点我认为表现出了意想不到的行为,(但我正在阅读错误的对象以进行比较):

d <-     structure(list(ma = c(284L, 284L, 284L, 284L, 284L, 284L, 284L, 
284L, 284L, 284L, 284L, 284L, 672L, 672L, 672L, 672L, 672L), 
    year = c(2011L, 2011L, 2011L, 2012L, 2011L, 2011L, 2011L, 
    2011L, 2011L, 2011L, 2011L, 2011L, 2012L, 2011L, 2012L, 2011L, 
    2012L), month = c(12L, 12L, 12L, 1L, 11L, 11L, 11L, 11L, 
    11L, 11L, 11L, 11L, 7L, 12L, 2L, 12L, 1L), trx_num = c(4L, 
    9L, 8L, 4L, 4L, 6L, 3L, 8L, 2L, 2L, 8L, 9L, 8L, 6L, 10L, 
    6L, 10L)), .Names = c("ma", "year", "month", "trx_num"), row.names = c(NA, 
-17L), class = c("data.table", "data.frame"), .internal.selfref = <pointer: 0x105afb0>, sorted = "ma")

构建它:

dat <- read.table(text=" ma year month n
 284 2011    12 3
 284 2012     1 1
 284 2011    11 5
 284 2011    11 1
 284 2011    11 2
 672 2012     7 1
 672 2011    12 1
 672 2012     2 1
 672 2011    12 1
 672 2012     1 1", header=TRUE)
require(data.table)
d <- data.table( data.frame(dat[rep(rownames(dat), times=dat$n), 1:3], trx_num=unlist(sapply(dat$n, sample, x=1:10)) ) )
setkey(d, ma)
d[,list(n=length(trx_num)),by=list(ma,year,month)]
d[,list(n=length(trx_num)),by=list(month,year,ma)]

此时很明显BlueMagister的解决方案是正确的:

d[,.N, by=list(month,year,ma)]
d[,.N, by=list(ma,year,month)] # same result modulo row order