将GNU R连接到PostgreSQL

Question

我安装了GNU R（S-like统计信息包;版本2.8.1）和PostgreSQL (8.4.1)，但我无法将GNU R连接到RDBMS。

当我第一次这样做（多年前 - 代码丢失）DBI R不存在。现在确实如此。我也很困惑使用哪个R包。快速搜索返回：

• RPostgreSQL似乎是最新的
• RPgSQL看起来被遗弃了。我希望他们能在他们的网页上刊登日期。 - （

我的Linux distribution没有打包R个套餐（具有讽刺意味），但我很乐意R CMD INSTALL package.tar.gz。

我安装了RPostgreSQL：很多文档都说要调用dbConnect但是我收到以下错误消息：Error: object "dbConnect" not found。

Answer 1

为了完整起见，您还有两个选项

• RODBC这是非常成熟且功能完备但与PostgreSQL，MySQL，SQLite，Oracle，......接口的DBI框架不对应。您还需要摆弄ODBC设置文件，这可能很棘手。但ODBC也可能对其他数据访问用途有用。
来自BioConductor项目的
• RdbiPgSQL，该项目也很成熟，但使用的另一个协议是与DBI竞争，从未接受过。这个PostgreSQL软件包很有用。

但作为RPostgreSQL维护者/共同作者，我很高兴你找到了这个。正如其他海报建议的那样，在发出命令之前尝试library(RPostgreSQL)。如果您遇到其他问题，请随时通过错误报告向我发送电子邮件。

编辑：还有一个选项是使用Joe Conway的PL/R在PostgreSQL中嵌入R。

Answer 2

也许您需要先运行require(RPostgreSQL)才能使用dbConnect？

Answer 3

我的猜测是你需要安装DBI包（大多数数据库包依赖于它）。

如果您在R中使用install.packages('RPpostgreSQL',dep=TRUE)，则应该处理任何依赖性问题。

Answer 4

RODBC对我很有用。您只需为要连接的数据库设置数据源名称（DSN）。我发现这很好，因为特定的连接信息不必存储在R中，并且可能因协作者而异。

另外，是的，听起来你没有加载RPostgresSQL包。