我有一个PDB文件,如下所示。我想在第5栏中给出一个空格。
ATOM 2614 CB ALA B1130 -3.307 -21.676 3.322 1.00 15.69 C
ATOM 2615 N LEU B1131 -4.584 -19.000 2.466 1.00 18.48 N
ATOM 2616 CA LEU B1131 -4.847 -17.586 2.701 1.00 18.86 C
期望的输出
ATOM 2614 CB ALA B 1130 -3.307 -21.676 3.322 1.00 15.69 C
ATOM 2615 N LEU B 1131 -4.584 -19.000 2.466 1.00 18.48 N
ATOM 2616 CA LEU B 1131 -4.847 -17.586 2.701 1.00 18.86 C
答案 0 :(得分:1)
awk '$5 = substr($5, 1, 1) " " substr($5, 2)' /tmp/foo.pdb
答案 1 :(得分:1)
如果你有傻瓜:
awk '{$5=gensub(/^./,"& ","g",$5)}1' file
答案 2 :(得分:1)
如果您需要制表符分隔输出,则可以使用awk
,如下所示:
awk -v OFS="\t" '{ sub(/./, "& ", $5) }1' file
结果:
ATOM 2614 CB ALA B 1130 -3.307 -21.676 3.322 1.00 15.69 C
ATOM 2615 N LEU B 1131 -4.584 -19.000 2.466 1.00 18.48 N
ATOM 2616 CA LEU B 1131 -4.847 -17.586 2.701 1.00 18.86 C