通过os.system将变量从python传递给bash shell脚本

Question

在下面的代码中，我构造了一个变量$ probe1，然后我想传递给bash脚本。我是下面的玩具示例，输出是空白的，即$ probe1无法识别os.system调用中的bash shell脚本。需要做什么？

for line1 in datfile:
    datmat=datmat+[line1.rstrip('\n').split('\t')]
        probe=datmat[i][0]
        snp1=datmat[i][2]
    probe1='permprobes'+probe+'pheno.pphe'
    os.system('echo $probe1')

Answer 1

似乎这就是你要做的事情：

In [2]: os.environ['probe1'] = 'hello'

In [3]: os.system('echo $probe1')
hello

但我不知道你为什么要这样做......

Answer 2

os.system('echo {0}'.format(probe1))

probe1是一个python变量，而不是一个shell变量。

os.environ['probe1'] = probe1

将bash环境变量设置为python变量内容。一旦python脚本退出，环境变量就会消失。