Question

我刚刚开始使用networkx并使用它来构建有根树。抱歉，如果这是一个微不足道的问题，我无法在其他地方找到解决方案。使用以下代码，我得到错误networkx.exception.NetworkXError：节点4没有位置。（在draw_networkx_nodes中）。

import networkx as nx 
import matplotlib.pyplot as plt
G = nx.DiGraph() 
G.add_node(1)
G.add_node(2)
G.add_node(3)
G.add_node(4)
G.add_node(5)
G.add_node(6)
G.add_edge(1,2) 
G.add_edge(1,3)
G.add_edge(2,5)
G.add_edge(2,6)
G.add_edge(3,4)
plt.title("Test") 
pos=nx.graphviz_layout(G,prog='dot') 
nx.draw(G,pos,with_labels=False,arrows=False) 
plt.savefig('nx_test.png')

一旦我创建节点4就会发生这种情况。例如，当我有节点1到4和边1,2 1,3和2,4时，我得到相同的错误。代码工作正常，直到我有节点4（3个节点运行良好）。无论我指定边缘的顺序如何，都会发生这种情况。

如果我直接指定边缘，我会得到同样的错误：

    >>> G4 = nx.DiGraph([(1, 2), (1, 3), (2, 5), (2, 6), (3, 4)])
    >>> nx.draw(G4,pos,with_labels=False,arrows=False) 


    Traceback (most recent call last):
       File "<stdin>", line 1, in <module>
      File "/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/networkx-1.7-py2.7.egg/networkx/drawing/nx_pylab.py", line 133, in draw
        draw_networkx(G,pos=pos,ax=ax,**kwds)
      File "/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/networkx-1.7-py2.7.egg/networkx/drawing/nx_pylab.py", line 266, in draw_networkx
        node_collection=draw_networkx_nodes(G, pos, **kwds)
      File "/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/networkx-1.7-py2.7.egg/networkx/drawing/nx_pylab.py", line 373, in draw_networkx_nodes
        raise nx.NetworkXError('Node %s has no position.'%e)
       networkx.exception.NetworkXError: Node 4 has no position.

由于

Answer 1

这是由于两件事：1）graphviz安装不正确，从头开始重新安装清除了错误。

其次，行

       pos=nx.graphviz_layout(G,prog='dot')

在绘制图形之前，必须始终放置（并重复）

，以计算新的节点/边缘。

networkx - 未知节点位置错误

1 个答案: