Question

我在Red Hat Linux 6服务器上运行R 2.15.2。我的目标是通过RODBC连接到另一台机器上的MS SQL Server数据库。我做了我的研究，并从the microsoft support website下载并安装了Linux版本的MS SQL ODBC驱动程序。我从源代码构建了unixODBC版本2.3.0，因为它是windows驱动程序所必需的，并且还没有在RHL repos中（repo版本是2.2.14）。

无论如何，经过一些工作，我终于安装并正确配置了驱动程序，并且我可以通过isql命令成功连接到SQL Server数据库：

$ isql -v test testuser testpass
+---------------------------------------+
| Connected!                            |
|                                       |
| sql-statement                         |
| help [tablename]                      |
| quit                                  |
|                                       |
+---------------------------------------+
SQL>

所以我知道我已正确设置odbc.ini和odbcinst.ini个文件。

但是，当我尝试从R中访问ODBC连接时，会发生以下情况：

> test <- odbcDriverConnect('DSN=test;Database=RSQLTest01;Uid=testuser;Pwd=testpass')
Warning messages:
1: In odbcDriverConnect("DSN=test;Database=RSQLTest01;Uid=testuser;Pwd=testpass") :
   [RODBC] ERROR: state IM002, code 0, message [unixODBC][Driver Manager]Data 
   source name not found, and no default driver specified
2: In odbcDriverConnect("DSN=test;Database=RSQLTest01;Uid=testuser;Pwd=testpass") :
   ODBC connection failed

以下是R中odbcDataSources命令的结果：

> odbcDataSources()
named character(0)

我一直在做一些研究，我认为解决方案（尽管我可能错了）可能与正确配置ODBC环境变量有关，这样RODBC就知道去哪里找odbc.ini。基于我的研究，我发现了以下可能相关的环境变量：$ODBCINI, $ODBCSYSINI, $ODBC_ROOT $ODBC_INCLUDE, and $ODBC_LIBS.我对这些应该设置的内容有一个合理的认识，但我不确定如何永久设置它们，以及RODBC可以识别在哪里找到合适的文件。

任何人都可以为我阐明这一点吗？我不确定我是否正确理解环境变量在linux中是如何工作的，特别是为什么isql连接没有问题，但是RODBC甚至找不到驱动程序/数据源。

注意：当我安装了unixODBC的repo版本时，RODBC将使用R中的install.packages('RODBC')命令安装得很好。但是，在我从源安装unixODBC 2.3.0后，RODBC安装将因为一个依赖问题，我不得不使用guide posted here从源代码安装RODBC。是否有可能我无法正确配置ODBC，这就是我现在遇到麻烦的原因？

Answer 1

哇，我以为我是唯一一个从事这类工作的人。我不得不解决同样的问题，发现最好的解决方案是使用rjdbc。这更容易配置，因为Linux或osx上的ODBC非常参差不齐。 RJDBC性能很好，因为它使用本机ms sql server jar来执行查询。以下是我们的一个脚本中的示例。您只需从microsoft下载sqljdbc4.jar，然后将install.package（“RJDBC”）下载到您的环境中。我意识到你正在努力让ODBC工作，我确实让它在osx上工作，但我放弃了由于时间的Linux。

library(RJDBC);  

drv <- JDBC('com.microsoft.sqlserver.jdbc.SQLServerDriver', '/usr/local/project/dataproviders/jdbc/sqljdbc4.jar', identifier.quote="'"); 

ch <- dbConnect(drv, 'jdbc:sqlserver://the.server.address.net;databaseName=DataWarehouse', 'USERNAME', 'PASSWORD'); 

allsupp_allprod_allproc <- dbGetQuery(ch, paste("SELECT  [Date], Sum([Fail]) as Numerator, Sum([Pass] + [Fail]) as Denominator,'' as Annotation,'True'  as 'Use for CL' FROM [PSU_YieldData] Group by [Date] Order by [Date]"));

Answer 2

在Ubuntu Server中我设置如下

编辑〜/ .bash_profile

nano ~/.bash_profile
添加以下行

export ODBCINI=/usr/local/etc/odbc.ini export ODBCSYSINI=/usr/local/etc

然后RODBC会很好用。

Answer 3

它无法找到驱动程序，因为您没有指定它！我不明白DSN的内容是如何工作的，但是在类似的情况下这对我有用：

ch <- odbcDriverConnect('driver={SQL Server};server=servername;database=databasename;uid=username;pwd=password;')
sqlQuery(ch,'sql script',stringsAsFactors = FALSE)

当然需要准确。并使用您拥有的任何驱动程序替换{SQL Server}。这是棘手的部分。 servername与下拉列表中的Management Studio相同，可能是＆＃34; test＆＃34;在你的情况下。 isql必须自动使用正确的驱动程序。

即。对于MySQL，它可能是：

Driver={MySQL ODBC 5.1 Driver};Server=localhost;Database=myDataBase;User=myUsername;Password=myPassword;Option=3;

我只是搜索＆＃34; mysql odbc连接字符串＆＃34;而不是具体的任何东西。

Answer 4

在Mac OS 10.13.3 High Sierra上配置unixODBC后，我也遇到了这个问题。我尝试配置.Renviron为ODBCINI设置R特定的环境变量，但RODBC仍然不会列出我的数据源名称（DSN）。另外，我无法找到在ODBCinst.ini中指定的驱动程序，甚至可以使用RODBC :: ODBCDriverConnect（）获取连接字符串，尽管能够连接isql。

我能够使JDBC连接正常工作，但我并不想依赖JVM，而且我已经为RODBCext编写了重要的数据库访问代码。

最终工作的原因很简单：

remove.packages('RODBC')
install.packages('RODBC', type="source")

看起来如果你从mac上安装了RODBC，它会正确地选择odbc.ini文件和odbcinst.ini文件。

感谢这篇帖子关于解锁密钥的微妙评论： http://eriqande.github.io/2014/12/19/setting-up-rodbc.html

RODBC无法识别我的odbc设置

4 个答案: