as.dendrogram出错

Question

我正在尝试使用大数据制作dendrpgram

我正在使用统计信息， phyclust 库，

distances <- phyclust.edist(Data[,],edist.model = .edist.model[3]) 
dataHClust <- hclust(distances, "ave")
dhc <- as.dendrogram(dataHClust)

hclust工作正常，我可以绘制它并正确绘制它。 在我使用as.dendrogram函数后，它不会给我一个错误。但当我要么：

• 尝试绘制
• 使用dendrapply来应用功能。

它说：

Error in lapply(args, is.character) : node stack overflow 
Error in dev.flush() : node stack overflow

as.dendrogram的问题是无法处理大型数据集（~30000）？ 如果是这样，有替代品吗？

Answer 1

我认为绘制大型数据集时会出现问题，因为我能够让您的代码在小型数据集上运行。

您可以尝试剪切树形图，使其适合h中height或as.dendrogram参数的情节。