Question

我有一堆模拟，我想在高性能集群上运行，我应该预约计算时间。由于预订受时间的限制，我正在开发一个自动化脚本，我可以scp进入集群并运行。然后，该脚本将下载相关的模拟文件，运行它们并上传结果。

此自动化脚本的一部分位于bash（cp，scp等），其余部分位于python中。为了开发这种自动化，我使用的是IPython笔记本。

到目前为止，我已经在我的IPython笔记本中编写了所有python自动化内容，并且我正在尝试编写它的bash部分。

然而，似乎魔术%%bash在我的IPython笔记本中不起作用。当我的单元格中包含此代码时，出现以下错误：

细胞

%%bash

echo hi

错误

  File "<ipython-input-22-62ec98e35224>", line 3
    echo hi
          ^
SyntaxError: invalid syntax

一时兴起，我试过这个：

细胞

%%bash

print "hi"

错误

hi
ERROR: Magic function `bash` not found.

所以我尝试使用%%system，%%!和%%shell。但这些都不起作用;他们都给了我同样的错误。

为什么会这样？我该如何解决这个问题？

元数据：

Answer 1

这是由版本错误引起的。我升级了我的IPython版本（现在为0.13.1），这很好用。

所以看起来这个问题是使用开发版本（这是我安装IPython时的最新版本）。

Answer 2

当您尝试在Windows ipython上使用%%bash时，您也会遇到类似的错误。那里没有%%bash。而是获得%%cmd。虽然cmd不是bash，但情况并不相同。