你如何改变ggplot2中复杂填充的颜色？

Question

我正在绘制具有不同疟疾寄生虫抗药性研究地点的地图。研究地点的大小相对于采集的疟疾寄生虫数量而言，这些点的填充是抗药性疟疾寄生虫比例的0到1的梯度。以下代码显示以下地图：

###GENERATING AFRICA MAP###
africa = readOGR("/Users/transfer/Documents/Mapping Files/Africa Countries/Africa_SHP",    layer="dissolved")
#FIXING THE NON-NODED INTERSECTS#
africa = gBuffer(africa, width=0, byid=TRUE)
#CREATING DATA FRAME FOR GGPLOT#
africa.map = fortify(africa, region="ID")

###PLOTTING SPM.437###
#SCALING THE SAMPLE SIZE USING CUBE-ROOT#
size = d.spm.437$Tot437^(1/3)
#PLOTTING#
ggplot(africa.map, aes(x = long, y = lat, group = group)) + 
    geom_polygon(colour="black",   size=0.25, fill="white", aes(group=group)) +
    geom_point(data = d.spm.437, aes(x = long, y = lat, fill=Frc437, group=NULL, size=Tot437), 
        size=size, shape=21, colour="black", size=0.5)

我尝试使用颜色选项，但它不起作用：

ggplot(africa.map, aes(x = long, y = lat, group = group)) + 
    geom_polygon(colour="black",   size=0.25, fill="white", aes(group=group)) +
    geom_point(data = d.spm.437, aes(x = long, y = lat, colour="red", fill=Frc437, group=NULL, size=Tot437), 
        size=size, shape=21, colour="black", size=0.5)

任何人都知道如何获得填充的颜色以显示红色，更轻的是0和更暗是1？

Answer 1

正如我在评论中提到的，我认为你对设置与绘图美学有点混淆。

您将美学映射到aes()内数据框中的变量。因此，aes(color = var)将颜色美学映射到变量var，您将获得一个图例，以显示颜色随var的变化情况。如果将{/ 1}}之外的颜色设置为单个值，则只需将所有点设置为单一颜色：aes()。

我怀疑你感到困惑的原因是你color = "red"内有size=Tot437，然后外面 aes()和size=size size=0.5。

最后，要更改调色板，您需要了解aes()函数（以及scale_color_*等）。这是一个让你入门的简单例子：

scale_fill_*, scale_size_*

我是如何想出那种疯狂的颜色规格？就在dat <- data.frame(x = rnorm(50), y = rnorm(50), f = runif(50)) library(ggplot2) library(munsell) cl <- mnsl(c("5R 2/4", "5R 7/10")) ggplot(dat,aes(x,y,fill = f)) + geom_point(size = 5,shape = 21) + scale_fill_gradient(low = cl[1],high = cl[2]) 的前几行，然后在munsell包中稍微戳了一下。

编辑：我完全错过了 实际使用的scale_fill_continuous这基本上是pch = 21美学有意义的唯一点形状，所以我编辑了删除我对该分数的评论。