我的数据安排如下。我的小组在列中,我有两组如下所示。我的实际数据集包含大约15个配对变量。
如何操作R中的这些数据(导入的csv)以便我可以比较这两组?例如,如果我想制作条形图(使用sciplot
库)bargraph.CI (var_x, group, data=mydata)
,我如何才能将这些列用作组?
Time var_x var_y var_x_2 var_y_2 var_z var_z_2
10:00 2 5 .33 .36 1.1 1.5
10:01 2 6 .34 .35 1.2 1.4
etc
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以下是基于reshape
的答案,但我确信有很多方法可以解决这个问题。
首先,重新创建测试数据:
test <- read.table(header=TRUE,textConnection("Time var_x var_y var_x_2 var_y_2 var_z var_z_2
10:00 2 5 .33 .36 1.1 1.5
10:01 2 6 .34 .35 1.2 1.4"))
> test
Time var_x var_y var_x_2 var_y_2 var_z var_z_2
1 10:00 2 5 0.33 0.36 1.1 1.5
2 10:01 2 6 0.34 0.35 1.2 1.4
重塑数据并保存到新的data.frame
testreshape <- reshape(test,
idvar="Time",
varying=list(c("var_x","var_x_2"),
c("var_y","var_y_2"),
c("var_z","var_z_2")),
v.names=c("var_x", "var_y", "var_z"),
direction="long")
> testreshape
Time time var_x var_y var_z
10:00.1 10:00 1 2.00 5.00 1.1
10:01.1 10:01 1 2.00 6.00 1.2
10:00.2 10:00 2 0.33 0.36 1.5
10:01.2 10:01 2 0.34 0.35 1.4
运行条形码代码:
library(sciplot)
bargraph.CI(var_x, time, data=testreshape)