Question

我在加载xlsx包并使用choose.files时遇到了一个奇怪的问题。

一旦我将RStudio更新到最新版本（v0.97.237），就会出现此问题。如果我启动RStudio然后加载xlsx（即library(xlsx)），程序包加载就好了。但是，如果我尝试使用choose.files()，则RStudio会冻结（实际上它会持续运行，无法在不使用Win7任务管理器的情况下结束）。如果我启动RStudio并首先使用choose.files，它可以正常工作。如果我然后运行library(xlsx)行，则xlsx包不会加载。它给出了以下错误。

我已尝试重新安装xlsx软件包（以及xlsxjars和rJava），但这并不起作用。也没有重新安装Java。

有什么建议吗？我使用R v2.15.2。

library(xlsx)  
Loading required package: xlsxjars  
Loading required package: rJava  
Error occurred during initialization of VM  
Could not reserve enough space for object heap  
Error : .onLoad failed in loadNamespace() for 'xlsxjars', details:  
  call: .jinit()  
  error: Cannot create Java virtual machine (-4)  
Error: package ‘xlsxjars’ could not be loaded

编辑：这就是问题所在。对不起任何困惑。当我输入这个：

filename<-file.choose() #select file
library(xlsx)
mydata<-read.xlsx(filename,1) #load datafile

我可以成功选择文件名，但xlsx包无法加载，因此我无法打开数据文件。我得到上面的错误。但是，如果我改为运行（在我关闭并重新启动RStudio之后）：

library(xlsx)
filename<-file.choose() #select file
mydata<-read.xlsx(filename,1) #load datafile

xlsx包正确加载，但file.choose导致R无限期运行，因此脚本冻结，我无法加载文件。使用choose.files()的情况也是如此。我不知道为什么这两件事（xlsx和file.choose / choose.files）会有冲突，但看起来它们是因为我只能使用其中一个，这取决于我先使用哪一个。

编辑2：我在不同的计算机（相同的操作系统，相同版本的R，RStudio和Java）上尝试过此操作，我遇到了同样的问题。

编辑3：我转回到RStudio v0.97.90，问题就消失了。我想这是一个RStudio问题。

Answer 1

我总是在顶部使用这些行：

options(java.parameters="-Xmx4000m")
options(java.home="C:/Program Files/Java/jre7/")

看看是否有帮助。

Answer 2

尝试从

清除临时文件

控制面板＆gt;节目＆gt; Java

看看它是否有效。

Answer 3

我最近在新机器上安装了R这个问题。确保您使用的是正确版本的Java（32位与64位）以匹配您的R版本。请注意，64位版本的Java在其主下载页面上找不到，但在“手动”d上找不到/ l页面here。

Answer 4

尝试其中一些套餐：

install.packages("XLConnect")
install.packages("xlsxjars")
install.packages("xlsx")

然后加载library()

使用read.xlsx2("blah.xlsx",sheetIndex=NULL)

不要使用file.choose，只需将文件直接插入read.xlsx2函数

或

read.xlsx2("blah.xlsx",sheetName=NULL")

Answer 5

其中一个较新的软件包是rio软件包。它解决了我遇到的许多导入和导出问题，并且还有一个额外的好处，即只需要一个库来导入/导出许多不同的格式。它根据文件名的扩展名确定格式。它似乎比其他一些软件包运行更干净，更快，即使它使用的功能基本相同。例如，对于Excel文件，它使用write.xlsx函数，但是当write.xlsx没有时，它对我有大数据集。可以找到包文档here。

install.packages("rio")    
library(rio)

import("myfile.xlsx")
export(df, "myfile.xlsx")

Answer 6

我推荐使用Hadley的readxl软件包，它从CRAN开始安装，没有Java依赖项。

library("readxl")
my_data <- read_excel(filename, sheet = 1)

与xlsx包和choose.files冲突

6 个答案: