Question

我正在使用HDF5 API，我正在尝试使用可变长度字符串创建数据集。结构是

struct dataX
{
  std::string data;
};

我使用的是char[256]静态硬编码大小但我希望它是动态的，所以在阅读HDF5文档后，我发现H5T_VARIABLE并使用它如下，但它仍然失败。

H5Dcreate返回负值（表示错误）。

hid_t mem_type;
mem_type = H5Tcopy( H5T_C_S1 );
H5Tset_size(mem_type,H5T_VARIABLE);

/* Create the memory data type. */
if ((mem_type_id = H5Tcreate (H5T_COMPOUND, mem_type )) < 0 ) {
  return -1;
}
/* Insert fields. */
if ( H5Tinsert(mem_type_id, "field", 0, mem_type_id ) < 0 ) {
  return -1;
}

/* Create a simple data space with unlimited size */
//   hsize_t dims[1]={0};
//   hsize_t maxdimsk[1]={ H5S_UNLIMITED };
if ( (sid = H5Screate_simple( 1, dims, maxdims )) < 0 ){
  return -1;
}

/* Modify dataset creation properties, i.e. enable chunking  */
plist_id = H5Pcreate (H5P_DATASET_CREATE);
//chunk==1
if ( H5Pset_chunk ( plist_id, 1, chunk ) < 0 ){
  return -1;
}

H5Pset_alloc_time( plist_id, H5D_ALLOC_TIME_EARLY )
/* Set the fill value using a struct as the data type. */
// fill_data=0
if ( fill_data )
{
  if ( H5Pset_fill_value( plist_id, mem_type_id, fill_data ) < 0 ){
    LOG_ERROR << "cannot fill value " << LOG_ENDL;
    return -1;
  }
}
else {
  if ( H5Pset_fill_time( plist_id, H5D_FILL_TIME_NEVER ) < 0 ) {
    LOG_ERROR << "error" << LOG_ENDL;
  }
}

/* Create the dataset. */
did = H5Dcreate( loc_id, dset_name, mem_type_id, sid, plist_id )

我试过H5D_ALLOC_TIME_LATE，认为如果它在写作之前分配了内存就可以了，但是......它没有。

现在我被困住了，我不知道该怎么做。

我错过了什么吗？

Answer 1

你的mem_type_id双重无效：

H5Tcreate的第二个参数应该是复合数据类型的大小
在H5Tinsert中，最后一个参数应该是插入字段的数据类型。我想你的意思是mem_type而不是mem_type_id。

我对你正在做的事情一无所知，但是要编写变长字符串，你不需要创建复合类型，也不需要设置任何特殊的属性列表。基本上，您的3个第一行足以创建有效的可变长度字符串数据类型（mem_type）。然后创建简单数据空间，然后创建数据集。

看看this example，你会发现它非常简单。

HDF5：使用字符串创建数据集

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