Question

我基本上有两个问题。

如何找到正在运行的默认Rprofile？我还没有设置Rprofile，所以我不确定它的运行位置。
我正在尝试使用该命令安装一些软件包（在主终端中执行SUDO之后）。

install.packages("RODBC","/home/rama/R/i486-pc-linux-gnu-library/2.9")

我收到一条错误，上面写着：

错误：无法锁定目录'/home/rama/R/i486-pc-linux-gnu-library/2.9'进行修改尝试删除'/ home / rama / R / i486-pc-linux-gnu-library /2.9/00LOCK'

下载的软件包位于'/ tmp / RtmpkzDMVU / downloaded_packages'警告信息：在install.packages（“RODBC”，“/ home / rama / R / i486-pc-linux-nuu-library / 9”中）： “RODBC”包的安装具有非零退出状态

Answer 1

对您的问题提出一些意见：

看看help(Startup)。您可能正在运行$R_HOME/etc/Rprofile [在我们创建软链接以连接它们时，它们在{Untntu和Debian上也可用/etc/R/Rprofile]并且您有$R_HOME/etc/Rprofile.site以及~/.Rprofile与...一起玩。
对于初学者，请在锁定文件上执行ls -l并查看它是否存在。如果是这样，如果您没有其他R进程正在运行，请删除。重新启动软件包安装。
RODBC需要ODBC库的开发标题以及所有这些 - 再次，对于Debian / Ubuntu，您只需说sudo apt-get install r-cran-rodbc。如果您运行另一个发行版，请查看它们是否已预先包装RODBC。
关于~/.Rprofile，您可以从this earlier StackOverflow question了解一些可能的提示和技巧。

Answer 2

关于您的软件包安装，我认为问题是“/home/rama/R/i486-pc-linux-gnu-library/2.9/00LOCK”。只是这个目录，安装将工作。

中文参考：http://cos.name/cn/topic/108555#post-239310

Answer 3

感谢您的回复。这确实有帮助！我使用sudo apt-get安装了我的RODBC软件包。那是无痛的。但是，关于哪个Rprofile正在运行，我仍然有点困惑。我确实在运行Ubuntu Jaunty。

当我执行whereis R命令时，我得到以下内容。

R：/ usr / bin / R / etc / R / usr / lib / R / usr / local / lib / R / usr / share / R /usr/share/man/man1/R.1.gz < / p>

在/ etc / R下我有

ldpaths Makeconf Renviron Renviron.site存储库Rprofile.site

如果我cd到/ usr / lib / R / etc，我有

ldpaths Makeconf Renviron Renviron.site存储库Rprofile.site

1）我的问题是，哪些用于运行R？

2）当我做一个sudo apt-get install r-cran-rodbc时，正在安装的软件包在哪里？

3）我在/home/rama/R/i486-pc-linux-gnu-library/2.9上有一个R的主文件夹，其中我的bioconductor包都位于。如何在这里安装sudo apt-get软件包？（？.Rprofile）甚至是必要的吗？

R包安装

3 个答案: