Question

我编写了一个小的python程序来迭代数据文件（ input_file ）并执行计算。如果计算结果达到某些状态（ stateA 或 stateB ），则会从结果中提取信息（ hits ）。提取的命中取决于三个参数集的参数我使用字典词典来存储我的参数集（ param_sets ）和列表来存储命中（ hits ）。字典 param_sets 和 hits 具有相同的键。

问题是，

hits 字典中的列表以某种方式耦合。当一个列表更改时（通过调用 extract_hits 函数），其他列表也会更改。

这里是（缩短的）代码：

import os, sys, csv, pdb
from operator import itemgetter

# define three parameter sets
param_sets = {
    'A' : {'MIN_LEN' : 8, 'MAX_X' : 0, 'MAX_Z' : 0},
    'B' : {'MIN_LEN' : 8, 'MAX_X' : 1, 'MAX_Z' : 5},
    'C' : {'MIN_LEN' : 9, 'MAX_X' : 1, 'MAX_Z' : 5}}

# to store hits corresponding to each parameter set
hits = dict.fromkeys(param_sets, [])

# calculations
result = []
for input_values in input_file:
    # do some calculations
    result = do_some_calculations(result, input_values)
    if result == stateA:
        for key in param_sets.keys():
            hits[key] = extract_hits(key, result,
                                                hits[key],
                                                param_sets[key]['MIN_LEN'],
                                                param_sets[key]['MAX_X'],
                                                param_sets[key]['MAX_Z'])
        result = []  # discard results, start empty result list
    elif result == stateB:
        for key in param_sets.keys():
            local_heli[key] = extract_hits(key,
                                           result,
                                           hits[key],
                                           param_sets[key]['MIN_LEN'],
                                           param_sets[key]['MAX_X'],
                                           param_sets[key]['MAX_Z'])
        result = [] # discard results
        result = some_calculation(input_values) # start new result list
    else:
        result = some_other_calculation(result) # append result list



def extract_hits(k, seq, hits, min_len, max_au, max_gu):
    max_len = len(seq)
    for sub_seq_size in reversed(range(min_len, max_len+1)):
        for start_pos in range(0,(max_len-sub_seq_size+1)):
            from_inc = start_pos
            to_exc = start_pos + sub_seq_size
            sub_seq = seq[from_inc:to_exc]
            # complete information about helical fragment sub_seq
            helical_fragment = get_helix_data(sub_seq, max_au, max_gu)
            if helical_fragment:
                hits.append(helical_fragment)
                # search seq regions left and right from sub_seq for further hits
                left_seq = seq[0:from_inc]
                right_seq = seq[to_exc:max_len]
                if len(left_seq) >= min_len:
                    hits = sub_check_helical(left_seq, hits, min_len, max_au, max_gu)
                if len(right_seq) >= min_len:
                    hits = sub_check_helical(right_seq, hits, min_len, max_au, max_gu)
                print 'key', k                 # just for testing purpose
                print 'new', hits              # just for testing purpose
                print 'frag', helical_fragment # just for testing purpose
                pdb.set_trace()                # just for testing purpose
                return hits # appended
    return hits # unchanged

这里是python调试器的一些输出：

key A
new ['x', 'x', 'x', {'y': 'GGCCGGGCUUGGU'}]
frag {'y': 'GGCCGGGCUUGGU'}
> 
-> return hits
(Pdb) c
key B

new [{'y': 'GGCCGGGCUUGGU'}, {'y': 'CCGGCCCGAGCCG'}]
frag {'y': 'CCGGCCCGAGCCG'}
> extract_hits()
-> return hits
(Pdb) c
key C
new [{'y': 'GGCCGGGCUUGGU'}, {'y': 'CCGGCCCGAGCCG'}, {'y': 'CCGGCCCG'}]
frag {'y': 'CCGGCCCG'}
> extract_hits()
-> return hits

键A 中的元素不应出现在键B 中，而键A和键B中的元素不应出现在键C 。

Answer 1

你的专栏：

hits = dict.fromkeys(param_sets, [])

相当于：

hits = dict()
onelist = []
for k in param_sets:
    hits[k] = onelist

也就是说，hits中的每个条目都具有SAME列表对象的值，最初为空，无论它具有什么密钥。请记住，赋值不执行隐式副本：而是指定“对RHS对象的另一个引用”。

你想要的是：

hits = dict()
for k in param_sets:
    hits[k] = []

即一个NEW AND SEPARATE列表对象作为每个条目的值。等价地，

hits = dict((k, []) for k in param_sets)

顺便说一句，当你做需要制作容器的（浅）副本时，最通用的方法通常是调用容器的类型，以旧容器作为参数，如：

newdict = dict(olddict)
newlist = list(oldlist)
newset = set(oldset)

等等;这也可以在类型之间转换容器（newlist = list(oldset)从列表中创建一个列表，等等。）

Answer 2

默认情况下，字典和列表通过引用传递。对于字典，而不是：

hits_old = hits      # just for testing purpose

它将是：

hits_old = hits.copy()      # just for testing purpose

这将复制字典的键/值配对，从而产生一个等效字典，不会包含对hits字典的未来更改。

当然，第二个函数中的hits_old实际上是一个列表，而不是一个字典，所以你想做一些类似于下面的事情来复制它：

hits_old = hits[:]

我不清楚为什么列表也没有copy（）函数，万一你想知道。

python：列表的字典以某种方式耦合

2 个答案: