Question

我有一个文件列表。我还有一个“名字”列表，我从这些文件的实际文件名中substr()。我想为列表中的每个文件添加一个新列。此列将包含“names”中相应元素，重复次数为文件中的行数。

例如：

df1 <- data.frame(x = 1:3, y=letters[1:3])
df2 <- data.frame(x = 4:6, y=letters[4:6])
filelist <- list(df1,df2)
ID <- c("1A","IB")

伪代码

  for( i in length(filelist)){

       filelist[i]$SampleID <- rep(ID[i],nrow(filelist[i])

  }

//基本上在filelist的每个数据框中创建一个新列，并用重复的相应ID值填充该列

我的输出应该是：

filelist[1]应该是：

   x y SAmpleID
 1 1 a       1A
 2 2 b       1A
 3 3 c       1A

fileList[2]

   x y SampleID
 1 4 d       IB
 2 5 e       IB
 3 6 f       IB

依旧.....

任何想法如何做到。

Answer 1

另一种解决方案是使用cbind，并利用R将重新定义较短向量的值这一事实。

例如

x <- df2  # from above
cbind(x, NewColumn="Singleton")
 #    x y NewColumn
 #  1 4 d Singleton
 #  2 5 e Singleton
 #  3 6 f Singleton

无需使用rep。 R为你做到了。

因此，您可以将cbind(filelist[[i]], ID[[i]])放入for loop或@Sven指出，您可以使用清洁工mapply：

filelist <- mapply(cbind, filelist, "SampleID"=ID, SIMPLIFY=F)

Answer 2

这是你的循环的更正版本：

for( i in seq_along(filelist)){

  filelist[[i]]$SampleID <- rep(ID[i],nrow(filelist[[i]]))

}

有3个问题：

身体中的命令后，最后)失踪。
列表元素由[[访问，而不是[。 [返回长度为1的列表。 [[仅返回元素。
length(filelist)只是一个值，因此循环仅针对列表的最后一个元素运行。我将其替换为seq_along(filelist)。

更有效的方法是使用mapply执行任务：

mapply(function(x, y) "[<-"(x, "SampleID", value = y) ,
       filelist, ID, SIMPLIFY = FALSE)

Answer 3

purrr的方式，使用map2

library(dplyr)
library(purrr)

map2(filelist, ID, ~cbind(.x, SampleID = .y))

#[[1]]
#  x y SampleId
#1 1 a       1A
#2 2 b       1A
#3 3 c       1A

#[[2]]
#  x y SampleId
#1 4 d       IB
#2 5 e       IB
#3 6 f       IB

或者也可以使用

map2(filelist, ID, ~.x %>% mutate(SampleId = .y))

如果您为列表命名，我们可以使用imap并根据其名称添加新列。

names(filelist) <- c("1A","IB")
imap(filelist, ~cbind(.x, SampleID = .y))
#OR
#imap(filelist, ~.x %>% mutate(SampleId = .y))

类似于使用Map

Map(cbind, filelist, SampleID = names(filelist))

Answer 4

一种棘手的方式：

library(plyr)

names(filelist) <- ID
result <- ldply(filelist, data.frame)

Answer 5

这个对我有用：

为列表中的每个数据框创建一个新列;根据现有列填充新列的值。（在您的情况下ID）。

示例：

# Create dummy data
df1<-data.frame(a = c(1,2,3))
df2<-data.frame(a = c(5,6,7))

# Create a list
l<-list(df1, df2)

> l
[[1]]
  a
1 1
2 2
3 3

[[2]]
  a
1 5
2 6
3 7

# add new column 'b'
# create 'b' values based on column 'a' 
l2<-lapply(l, function(x) 
  cbind(x, b = x$a*4))

结果：

在你的情况下：

filelist<-lapply(filelist, function(x) 
  cbind(x, b = x$SampleID))

Answer 6

data_lst <- list(
  data_1 = data.frame(c1 = 1:3, c2 = 3:1),
  data_2 = data.frame(c1 = 1:3, c2 = 3:1)
)

f <- function (data, name){
  data$name <- name
  data
}

Map(f, data_lst , names(data_lst))

将新列添加到表或数据框列表中的每个元素

6 个答案: