修改R包的源代码

Question

我想删除一行：

if( nrow(mm) <= ncol(mm) )

来自bioconductor包“DEXSeq”怎么做？

Answer 1

R包只是一个包含多个目录和文件的存档。您可以随意修改它们。下载包 - 它将以＃34; .tar.gz＆＃34;的形式结尾。打开包装;在许多系统中，以下（从命令行）将起作用：

tar xzf package.tar.gz

或者，如果你有zip的Windows版本的软件包（package.zip），只需将其解压缩即可。

输入已创建的目录，输入目录＆＃34; R＆＃34;并找到包含您的函数的文件：

cd package
cd R
grep "if( nrow(mm) <= ncol(mm) )" *.R

编辑它，然后再次重新包装：

cd ../..
tar czf package_mine.tar.gz

或者，在Windows中，将目录压缩回package.zip表单。

您现在可以安装和使用package_mine。

这不是唯一的方法，并且规范地应该使用R重建包。但是，对于小的修改并快速尝试它将会做的事情。