matlab：具有大量数据点的散点图

Question

我正在尝试绘制散点图，例如：

scatter(coor(:, 2), coor(:, 3), 1, coor(:, 4));

问题是，我有很多坐标要绘制（~100 000）。它花了很长时间来绘制它，当我尝试将图形输出到tiff时 - 然后matlab已经死了好几分钟...任何改善绘图的解决方案，或者至少是tiff export？

编辑： 忘了提，第三坐标（coor（：，4））是一个颜色代码。

所以，当我使用分散（如上所述）时，我在下面的图像上有类似的东西，这就是我想要看到的东西（只是它超级慢，我无法导出）：

当我这样做时：

  

plot3（coor（：，2），coor（：，3），coor（：，4），'。'）

效果不再那么酷（注意：图像不是来自相同的坐标......）：

Answer 1

您可以使用plot，但所有点都具有相同的颜色。但是，您可以在不同的子集中划分集合，并使用自己的颜色绘制每个集合：

N = 100000;
x = rand(N,1);
y = rand(N,1);
C = sin(2*x)+y;

cdivs = 10;
[~, edges] = hist(C,cdivs-1);
edges = [-Inf edges Inf]; % to include all points
[Nk, bink] = histc(C,edges);

figure;
hold on;
cmap = jet(cdivs);
for ii=1:cdivs
    idx = bink==ii;
    plot(x(idx),y(idx),'.','MarkerSize',4,'Color',cmap(ii,:));
end

colormap(cmap)
caxis([min(C) max(C)])
colorbar

响应已经比scatter(x,y,1,C)好很多，它给出了相同的情节，但颜色分辨率更高（可以在上面的代码中调整）。

Answer 2

我的经验是，matlab中最有效的绘图命令是Patch，我用它来模拟散射或散射3的功能，效率更高。

如果您有一个点列表，请使用每个点为您的特定数据定义合理边长的方形补丁（或八边形或其他），然后通过一次调用补丁来绘制补丁集合。创建图形对象后，您可以更新其颜色数据以单独为正方形着色。

您可以通过在数据集中构建立方体或3D十字架，在3D中使用相同的概念。

此片段创建1e5个随机放置的方块，在这种情况下使用随机颜色，并在我四岁的笔记本电脑上以不到一秒的速度运行。对散射的类似调用需要40秒，并返回难以操作的难以操作的数字。

tic
P=rand(1e5,2);
Edge=.01;
X=[P(:,1)'; P(:,1)'+Edge; P(:,1)'+Edge; P(:,1)'];
Y=[P(:,2)'; P(:,2)'; P(:,2)'+Edge; P(:,2)'+Edge];
figure;
h=patch(X,Y,'r');
set(h,'facevertexcdata',rand(size(X,2),3),'facecolor','flat','edgecolor','none')
drawnow
toc

Answer 3

是的，使用plot3

plot3(coor(:, 2), coor(:, 3), coor(:, 4), '.')

这与三维散点图相同（点数为小点，如果需要，也可以使用'o' or 'x'）

Answer 4

如果您有太多分数，那么精简数据可能是有意义的。

基本上你可以做两种方法：

1. 简单 - 只需选择 - 随机说出10％的分数。

2. 丢弃不可见的点，显然是那些超出你范围的点，但如果你有很多重叠点 - 比如说一个点的直径应该是3px - 所以一点可以说是9px。在我的机器上，你发布的情节就是 - 比如400x400px，所以最多可以看到ceil(400*400/9) < 20 000个数据点。

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你也可以尝试将情节分成更小的块 - 比如绘制1000点，发出drawnow然后发出下一个1000直到你完成。所以你不必在空白屏幕前等待。