如何将绘图附加到现有的pdf文件

时间:2012-11-07 16:10:04

标签: r pdf plot

我希望在dev.off()被调用*之后很久就将一个情节添加到现有的pdf中。阅读pdf()帮助文件后阅读Q&一个herehere,我很确定它不能在R中完成。但是,也许你们中的一些聪明人有一个我无法找到的解决方案。

pdf("Append to me.%03d.pdf",onefile=T)
plot(1:10,10:1) #First plot (page 1)
dev.off()
pdf("Append to me.%03d.pdf",onefile=T)
plot(1:10,rep(5,10)) #Want this one on page 2
dev.off()

*这不是上面链接的问题的重复,因为我想在 pdf设备关闭后附加到pdf文件

5 个答案:

答案 0 :(得分:21)

您可以使用recordPlot将每个地图存储在list中,然后使用replayPlot将它们全部写入pdf文件。这是一个例子:

num.plots <- 5
my.plots <- vector(num.plots, mode='list')

for (i in 1:num.plots) {
    plot(i)
    my.plots[[i]] <- recordPlot()
}
graphics.off()

pdf('myplots.pdf', onefile=TRUE)
for (my.plot in my.plots) {
    replayPlot(my.plot)
}
graphics.off()

答案 1 :(得分:17)

如果您愿意安装小型,免费,与平台无关的pdftk实用程序,您可以使用R中的系统调用将所有数字拼接在一起:

## A couple of example pdf docs
pdf("Append to me.1.pdf")
plot(1:10,10:1)
dev.off()

pdf("Append to me.2.pdf")
plot(1:10,rep(5,10)) 
dev.off()

## Collect the names of the figures to be glued together
ff <- dir(pattern="Append to me")
## The name of the pdf doc that will contain all the figures
outFileName <- "AllFigs.pdf"

## Make a system call to pdftk
system2(command = "pdftk",
        args = c(shQuote(ff), "cat output", shQuote(outFileName)))

## The command above is equiv. to typing the following at the system command line
## pdftk "Append to me.1.pdf" "Append to me.2.pdf" cat output "AllFigs.pdf"

答案 2 :(得分:6)

这非常hacky并且可能掩盖了我有限的UNIX shell fu,但它适用于安装了pdfjam package的Fedora 17盒子(不是R包,但来自YUM repos)

pdf("pdf1.pdf")
plot(1:10)
dev.off()

pdf("| pdfjoin --outfile \"pdf2.pdf\" && pdfjoin pdf1.pdf pdf2.pdf --outfile pdf1.pdf && rm pdf2.pdf")
plot(10:1)
dev.off()

R中的输出是:

> pdf("| pdfjoin --outfile \"pdf2.pdf\" && pdfjoin pdf1.pdf pdf2.pdf --outfile pdf1.pdf && rm pdf2.pdf")## && pdfunite joined.pdf tmp.pdf joined.pdf && rm tmp.pdf")
> plot(10:1)
> dev.off()
          ----
  pdfjam: This is pdfjam version 2.08.
  pdfjam: Reading any site-wide or user-specific defaults...
          (none found)
  pdfjam: No PDF/JPG/PNG source specified: input is from stdin.
  pdfjam: Effective call for this run of pdfjam:
          /usr/bin/pdfjam --fitpaper 'true' --rotateoversize 'true' --suffix joined --outfile pdf2.pdf -- /dev/stdin - 
  pdfjam: Calling pdflatex...
  pdfjam: Finished.  Output was to 'pdf2.pdf'.
          ----
  pdfjam: This is pdfjam version 2.08.
  pdfjam: Reading any site-wide or user-specific defaults...
          (none found)
  pdfjam: Effective call for this run of pdfjam:
          /usr/bin/pdfjam --fitpaper 'true' --rotateoversize 'true' --suffix joined --outfile pdf1.pdf -- pdf1.pdf - pdf2.pdf - 
  pdfjam: Calling pdflatex...
  pdfjam: Finished.  Output was to 'pdf1.pdf'.
null device 
          1

基本上,pdfjoin将从stdin获取输入,如果它是唯一的输入文件,那么我将pdf()的输出传递给pdfjoin程序并指定输出文件使用--outfile参数。然后使用&&将原始pdf1.pdf与刚创建的pdf2.pdf合并,指定输出PDF为pdf1.pdf,即原始PDF的名称。

答案 3 :(得分:1)

我最近发现了这项出色的作品(并没有试图将其声称为我自己的作品)

https://jonkimanalyze.wordpress.com/2014/07/24/r-compile-png-files-into-pdf/

这不是OP所要求的,但我喜欢它的原因是我经常有非常密集的散点图和其他对窗口调整大小等特别不敏感的情节。 PDF格式。但是我需要生成多页输出。因此,如果图是数据密集的,我将它们渲染为.pngs,然后使用上面的函数重新组合。

merge.png.pdf <- function(pdfFile, pngFiles, deletePngFiles=FALSE) {

  pdf(pdfFile)

  n <- length(pngFiles)

  for( i in 1:n) {


    pngFile <- pngFiles[i]

    pngRaster <- readPNG(pngFile)

    grid.raster(pngRaster, width=unit(0.8, "npc"), height= unit(0.8, "npc"))

    if (i < n) plot.new()

  }

  dev.off()

  if (deletePngFiles) {

    unlink(pngFiles)
  }

}

答案 4 :(得分:-2)

pdf("myFile.pdf",onefile=T)

plot(1:10,10:1) #First plot (page 1)
plot(1:10,rep(5,10)) #Want this one on page 2

dev.off()