有点令人尴尬/不禁,但由于我已经从“纯粹的用户”转变为“初学者 - 开发者”并没有那么久,我从未真正阅读过CHANGELOG版本出来了 - 直到今天(我觉得我应该把它作为习惯); - )
然而,我不确定所谓的改变是否真的发生了,因为我在第一次看到R R 2.15.2的CHANGELOG时找不到任何关于它的信息:
软件包存储库的(子目录)结构是否可能从
更改 ./bin/windows/contrib/2.xx/
到
./src/contrib/2.xx/
甚至是./src/contrib
?
或者至少PACKAGES
文件现在需要住在这里:./src/contrib/PACKAGES
?
最高版本2.15.1,以下路径用于从我的本地软件包存储库安装软件包:
path.repos <- "L:/R/packages"
repos <- file.path("file://", path.repos)
函数contrib.url
将repos
并将其展开到正确的子目录:
> contrib.url(repos)
[1] "file:///L:/R/packages/bin/windows/contrib/2.15"
但是当我尝试运行install.packages()
时,我得到R 2.15.2的以下错误:
> install.packages("mypkg",
+ lib=file.path(R.home(), "library"),
+ repos=repos,
+ type="win.binary"
+ )
Error in read.dcf(file = tmpf) : cannot open the connection
In addition: Warning message:
In read.dcf(file = tmpf) :
cannot open compressed file 'L:/R/packages/src/contrib/PACKAGES', probable reason 'No such file or directory'
>
当我对R 2.15.1做同样的事情时,一切顺利。
CHANGELOG中有一些关于存储库的引用,但是我发现的唯一部分给了我一些证据,证明所发生的假设是这样的:
包装安装
对于Windows或Mac OS X二进制包安装,install.packages()将检查源包是否在同一存储库中可用,并报告它是否是更高版本或是否有源包但没有二进制包可用。
再次看一下official documentation,并认为arg type
可能没有正确传递给contrib.url()
,因为我认为install.package()
正在寻找在type="source"
包裹的地方?
答案 0 :(得分:2)
此特定错误与mine不同。
此问题与现在在安装之前运行的检查install.packages()
有关。正如拉普斯特所说,tries to find a source package to compare the binary version with:
对于Windows或Mac OS X二进制包安装,install.packages()将检查源包是否在同一存储库中可用,并报告它是否是更高版本或是否有源包但没有二进制包可用。
因此,压缩此消息的一种简单方法是创建R/src/contrib
目录并在该目录中运行tools::write_PACKAGES()
以创建(空)PACKAGES
文件。
当然,您在2.15.1中没有收到此消息的原因是它不执行2.15.2执行的检查(参见上面的R NEWS引用)。
我已提交bug report个问题。还没有消息。也可以将它发布到R邮件列表。