我一直在使用Knitr通过R-Studio,并认为它非常整洁。我有一个小问题。当我在R-Chunk中获取文件时,knitr输出包括如下外部注释:
+ FALSE Loading required package: ggplot2
+ FALSE Loading required package: gridExtra
+ FALSE Loading required package: grid
+ FALSE Loading required package: VGAM
+ FALSE Loading required package: splines
+ FALSE Loading required package: stats4
+ FALSE Attaching package: 'VGAM'
+ FALSE The following object(s) are masked from 'package:stats4':
我试图以各种方式设置R-chunk选项,但似乎仍然没有避免这个问题:
```{r echo=FALSE, cache=FALSE, results=FALSE, warning=FALSE, comment=FALSE, warning=FALSE}
source("C:/Rscripts/source.R");
```
有没有办法评论这些消息?
答案 0 :(得分:230)
您可以使用include=FALSE
排除大块中的所有内容。
```{r include=FALSE}
source("C:/Rscripts/source.R")
```
如果您只想取消消息,请改用message=FALSE
:
```{r message=FALSE}
source("C:/Rscripts/source.R")
```
答案 1 :(得分:85)
```{r results='hide', message=FALSE, warning=FALSE}
library(RJSONIO)
library(AnotherPackage)
```
请参阅Knitr文档中的Chunk Options
答案 2 :(得分:6)
我对R Markdown的最佳解决方案是创建一个代码块,仅用于加载库并排除块中的所有内容。
{r results='asis', echo=FALSE, include=FALSE,}
knitr::opts_chunk$set(echo = TRUE, warning=FALSE)
#formating tables
library(xtable)
#data wrangling
library(dplyr)
#text processing
library(stringi)
答案 3 :(得分:3)
这是一个老问题,但这是另一种方法。
您可以通过将source
调用包裹在suppressPackageStartupMessages()
,suppressMessages()
和/或suppressWarnings()
中来修改R代码本身而不是块选项。 E.g:
```{r echo=FALSE}
suppressWarnings(suppressMessages(suppressPackageStartupMessages({
source("C:/Rscripts/source.R")
})
```
您还可以将这些功能放在library()
脚本中的"source.R"
来电。