我有这样的情况:
Gene SAMPLE1 SAMPLE2
G1 0.33 0.21
G2 0.45 0.324
G3 0.765 0.654
G4 0.98 0.543
G5 0.565 0.13
G6 0.123 0.943
G7 0.321 0.572
.... ... ......
数据不是真实数据。 我需要:计算双面Pearson相关性检验的p值。
有人能帮帮我吗?我是R的新人。
答案 0 :(得分:1)
您可以使用cor.test
执行此相关性测试。这是任何标准R分发的一部分。在您的情况下,with(dat, cor.test(Sample1, Sample2))
将执行您需要的测试。
Google搜索R correlation test
返回了cor.test
的文档作为第一个结果。
答案 1 :(得分:0)
如上所述,您可以使用cor.test()函数:
cor.test(data$SAMPLE1, data$SAMPLE2)
如果您是R的初学者,则在此广泛描述两个变量之间的相关性测试:
http://www.sthda.com/english/wiki/correlation-test-between-two-variables
您也可以在线进行皮尔森相关性测试,无需任何安装: