Matlab 3D体积可视化 - dicom文件

时间:2012-10-26 09:35:18

标签: matlab 3d dicom

我期待从dicom文件中将3D矩阵可视化到matlab中。由于我对matlab不太熟悉,我设法从this post获得了帮助:

不同之处在于我的矩阵不是由1和0组成,而是由imshow(dicomeread(dicomFile))

组成的正数为红色的负数

如何使用3D渲染获得相同的对比度?

我的代码:

dicomFilesZm = dir(fullfile(myDcmFolder, 'SLZ-*.dcm')); %Get files name
dicomFilesZp = dir(fullfile(myDcmFolder, 'SLZ+*.dcm')); %~

Z = dicomFilesZm(end:-1:1); % sort

dicomFilesZ = [Z ; dicomFilesZp]; % recompose final array with files name

Iz1 = fullfile(myDcmFolder, dicomFilesZ(1).name); 
v = NaN([size(dicomread(Iz1)) numel(dicomFilesZ)]); % creation of empty matrix with the good size    
for i = 1 : numel(dicomFilesZ)
    Iz = fullfile(myDcmFolder, dicomFilesZ(i).name);
    v(:,:,i) = dicomread(Iz); % fill the matrix with each image
end

p = patch( isosurface(v,0) );
isonormals(v, p)
set(p, 'FaceColor','r', 'EdgeColor','none')
daspect([1 1 1])

感谢您的帮助。

1 个答案:

答案 0 :(得分:3)

解决问题的两个选项:

  1. 天真地,你为什么不设置v=v+min(v(:))所以图像会从零扩展到不同的最大值?

  2. 为什么带有负isovlaue的isosurface(V,isovalue)不会为您解决此问题? 或者,如果你想要从(-n:step_size:m)的isovalues循环获得你想要的动态范围(用一些alpha(0.2)来查看你想要的图层)