Question

我有两张桌子。一个是“探针”，另一个是“成绩单”。

探针表：“探测”

ProbeID ------- ---- TranscriptID

2655       4555555
2600       5454542
2600       4543234
2344       5659595

...等

成绩单表：“成绩单”

TranscriptID ---- ----位置

7896736      chr1
5454542      chr1

...等

我需要找出每条染色体有多少个转录本？每条染色体有多少个探针？

SELECT COUNT(*) 
FROM transcript

='28869'#Above我认为给我每条染色体的转录本（即位置）。

我需要帮助回答第二部分（首先，如果错误的话）。我假设我需要使用JOIN子句。

谢谢。

Answer 1

每个染色体的探测次数

SELECT Location, COUNT(ProbeID) AS ProbeCnt
FROM transcript T
JOIN probe P ON P.TransciprtID = T.TranscriptID
GROUP BY Location
-- optionally you can ORDER BY to either get
-- ORDER BY COUNT(ProbID) DESC  --  list in descending order of nb of probes
-- ORDER BY Location            --  list in order of chromosome name

关于您的第一个查询，这是不正确的。得到
每条染色体的转录本数，您需要

SELECT Location, COUNT(TranscriptID) as TransCnt
FROM transcript
GROUP BY Location

您当前的查询提供整个转录表的转录本总数，无论染色体如何。

Answer 2

成绩单计数

select location, count(location) AS transacripts_num 
from transcript GROUP by location;

探测计数

select location, count(location) AS probe_num 
from transcript t join probe p
ON t.transcriptId= p.probeId
GROUP by location;

计算和加入表格

2 个答案: