Question

到目前为止，我一直无法找到一个可以创建像John Stasko那样的旭日阴谋的R库。任何人都知道如何在R或Python中实现它？

Sunburst

Answer 1

您甚至可以使用R现在轻松构建交互式版本：

# devtools::install_github("timelyportfolio/sunburstR")

library(sunburstR)
# read in sample visit-sequences.csv data provided in source
# https://gist.github.com/kerryrodden/7090426#file-visit-sequences-csv
sequences <- read.csv(
  system.file("examples/visit-sequences.csv",package="sunburstR")
  ,header=F
  ,stringsAsFactors = FALSE
)

sunburst(sequences)

...当你将鼠标移到它上面时，神奇就会发生：

修改
这个软件包的官方网站可以在这里找到（有很多例子！）：https://github.com/timelyportfolio/sunburstR

帽子提示@timelyportfolio谁创造了这段令人印象深刻的代码！

Answer 2

使用极坐标投影中的matplotlib条形图的旭日形图的Python版本：

data = [
    ('/', 100, [
        ('home', 70, [
            ('Images', 40, []),
            ('Videos', 20, []),
            ('Documents', 5, []),
        ]),
        ('usr', 15, [
            ('src', 6, [
                ('linux-headers', 4, []),
                ('virtualbox', 1, []),

            ]),
            ('lib', 4, []),
            ('share', 2, []),
            ('bin', 1, []),
            ('local', 1, []),
            ('include', 1, []),
        ]),
    ]),
]

sunburst(data)

示例，如何使用此功能：

devtools::install_github("joshuaulrich/xts")

Answer 3

您可以使用geom_tile包中的ggplot2在旭日情节的线条上创建一些内容。我们先创建一些随机数据：

require(ggplot2); theme_set(theme_bw())
require(plyr)
dat = data.frame(expand.grid(x = 1:10, y = 1:10),
                 z = sample(LETTERS[1:3], size = 100, replace = TRUE))

然后创建栅格图。此处，图中的x轴与x中的dat变量，y轴上的y变量以及z变量的填充相关联。 p = ggplot(dat, aes(x = x, y = y, fill = z)) + geom_tile() print(p)变量的像素。这产生了以下图：

ggplot2

enter image description here

p + coord_polar()包支持所有类型的坐标转换，其中一个采用一个轴并将其投影到一个圆上，即极坐标：

dat

enter image description here

这大致可以满足您的需求，现在您可以通过调整{{1}}来获得所需的结果。

Answer 4

Theres一个名为ggsunburst的包。遗憾的是，不在CRAN中，但您可以按照网站上的说明进行安装：http://genome.crg.es/~didac/ggsunburst/ggsunburst.html。

希望对那些仍在寻找这样的好包装的人有所帮助。

此致

Answer 5

我所知道的只有几个库可以原生这样做：

Javascript Infovis Toolkit（jit）（example）。
D3.js
OCaml的Simple Plot Tool（SPT）。

这些都不是Python或R，但是获得一个python / R脚本来写出一个可以由任何一个javascript库加载的简单JSON文件应该是非常容易实现的。

Answer 6

这里有一层ggplot2 sunburst，有两层。

基本思想是为每个图层创建一个不同的条形图，并使外部图层的条形图更宽。我也与x轴混淆，以确保内部饼图中间没有洞。因此，您可以通过更改宽度和x轴值来控制旭日形的外观。

library(ggplot2)

# make some fake data
df <- data.frame(
    'level1'=c('a', 'a', 'a', 'a', 'b', 'b', 'c', 'c', 'c'), 
    'level2'=c('a1', 'a2', 'a3', 'a4', 'b1', 'b2', 'c1', 'c2', 'c3'), 
    'value'=c(.025, .05, .027, .005, .012, .014, .1, .03, .18))

# sunburst plot
ggplot(df, aes(y=value)) +
    geom_bar(aes(fill=level1, x=0), width=.5, stat='identity') + 
    geom_bar(aes(fill=level2, x=.25), width=.25, stat='identity') + 
    coord_polar(theta='y')

与森伯斯特专用软件相比，它唯一的缺点是它假设你希望外层是集体穷举的（即没有间隙）。＆＃34;部分详尽无遗＆＃34;外层（就像其他一些例子中）肯定是可能的，但更复杂。

为了完整性，这里使用更好的格式和标签进行清理：

library(data.table)

# compute cumulative sum for outer labels
df <- data.table(df)
df[, cumulative:=cumsum(value)-(value/2)]

# store labels for inner circle
inner_df <- df[, c('level1', 'value'), with=FALSE]
inner_df[, level1_value:=sum(value), by='level1']
inner_df <- unique(text_df[, c('level1', 'level1_value'), with=FALSE])
inner_df[, cumulative:=cumsum(level1_value)]
inner_df[, prev:=shift(cumulative)]
inner_df[is.na(prev), position:=(level1_value/2)]
inner_df[!is.na(prev), position:=(level1_value/2)+prev]

colors <- c('#6a3d9a', '#1F78B4', '#33A02C', '#3F146D', '#56238D', '#855CB1', '#AD8CD0', '#08619A', '#3F8DC0', '#076302', '#1B8416', '#50B74B')
colorNames <- c(unique(as.character(df$level1)), unique(as.character(df$level2)))
names(colors) <- colorNames

ggplot(df, aes(y=value, x='')) +
    geom_bar(aes(fill=level2, x=.25), width=.25, stat='identity') + 
    geom_bar(aes(fill=level1, x=0), width=.5, stat='identity') + 
    geom_text(data=inner_df, aes(label=level1, x=.05, y=position)) + 
    coord_polar(theta='y') + 
    scale_fill_manual('', values=colors) +
    theme_minimal() + 
    guides(fill=guide_legend(ncol=1)) +
    labs(title='') + 
    scale_x_continuous(breaks=NULL) + 
    scale_y_continuous(breaks=df$cumulative, labels=df$level2, 5) + 
    theme(axis.title.x=element_blank(), axis.title.y=element_blank(), panel.border=element_blank(), panel.grid=element_blank())

Answer 7

由于jbkunst提到了ggsunburst，在这里我发布了一个用sirex复制sunburst的例子。

它不完全相同，因为在ggsunburst中，节点的角度等于其子节点的角度之和。

builder.setPositiveButton(mContent.getString(R.string.BtnYes)) { dialog, which ->

            val handler = Handler()
            handler.postDelayed({  mActivity.finish() }, 300)
        }

Answer 8

以下是使用R和plotly（基于我的回答here）的示例：

library(datasets)
library(data.table)
library(plotly)

as.sunburstDF <- function(DF, valueCol = NULL){
  require(data.table)
  
  colNamesDF <- names(DF)
  
  if(is.data.table(DF)){
    DT <- copy(DF)
  } else {
    DT <- data.table(DF, stringsAsFactors = FALSE)
  }
  
  DT[, root := names(DF)[1]]
  colNamesDT <- names(DT)
  
  if(is.null(valueCol)){
    setcolorder(DT, c("root", colNamesDF))
  } else {
    setnames(DT, valueCol, "values", skip_absent=TRUE)
    setcolorder(DT, c("root", setdiff(colNamesDF, valueCol), "values"))
  }
  
  hierarchyCols <- setdiff(colNamesDT, "values")
  hierarchyList <- list()
  
  for(i in seq_along(hierarchyCols)){
    currentCols <- colNamesDT[1:i]
    if(is.null(valueCol)){
      currentDT <- unique(DT[, ..currentCols][, values := .N, by = currentCols], by = currentCols)
    } else {
      currentDT <- DT[, lapply(.SD, sum, na.rm = TRUE), by=currentCols, .SDcols = "values"]
    }
    setnames(currentDT, length(currentCols), "labels")
    hierarchyList[[i]] <- currentDT
  }
  
  hierarchyDT <- rbindlist(hierarchyList, use.names = TRUE, fill = TRUE)
  
  parentCols <- setdiff(names(hierarchyDT), c("labels", "values", valueCol))
  hierarchyDT[, parents := apply(.SD, 1, function(x){fifelse(all(is.na(x)), yes = NA_character_, no = paste(x[!is.na(x)], sep = ":", collapse = " - "))}), .SDcols = parentCols]
  hierarchyDT[, ids := apply(.SD, 1, function(x){paste(x[!is.na(x)], collapse = " - ")}), .SDcols = c("parents", "labels")]
  hierarchyDT[, c(parentCols) := NULL]
  return(hierarchyDT)
}

DF <- as.data.table(Titanic)
setcolorder(DF, c("Survived", "Class", "Sex", "Age", "N"))
sunburstDF <- as.sunburstDF(DF, valueCol = "N")

# Sunburst
plot_ly(data = sunburstDF, ids = ~ids, labels= ~labels, parents = ~parents, values= ~values, type='sunburst', branchvalues = 'total')

# Treemap
# plot_ly(data = sunburstDF, ids = ~ids, labels= ~labels, parents = ~parents, values= ~values, type='treemap', branchvalues = 'total')

可以找到其他一些here信息。

如何用R或Python制作一个旭日形图？

8 个答案: