所以我仍在编码,甚至不确定这一切是否仍然有效,但是当我甚至无法运行它时很难测试它。这是我第一次尝试使用多个可选输入,每次运行时都会出现错误:
“命令行参数错误:参数”查询“。文件无法访问:`sequence_filename'”
命令行输入是文件名(require),然后是函数将运行的可选输出文件,然后是prot的可选变量(如果它是蛋白质,defualt)或na,如果它是核酸
if __name__ == '__main__':
sequence_filename = sys.argv[1]
output_filename = ''
if sys.argv > 3:
output_filename = sys.argv[2]
if sys.argv[3] == 'na':
input = 'na'
else:
input = 'prot'
elif sys.argv > 2:
output_filename = sys.argv[2]
main( sequence_filename, output_filename, input )
提前感谢。