Question

我正在尝试将我用C ++创建的程序重新创建到C＃windows窗体程序中，我已经完成了大部分工作。有一件小事让程序无法正常工作。

我的程序是一个生物信息学程序，允许用户输入DNA或RNA字符的字符串/序列，程序将其转换为相应的蛋白质/氨基酸，并为程序的每个密码子打印出氨基酸/蛋白质看到。因此，如果我输入“AAA GGG CCC”，它会打印出“赖氨酸甘氨酸脯氨酸”。

这是我在C ++版本中遇到问题的代码片段

for (i=0; i<numberOfCodons;i++)
{
    endIndex=beginIndex+3;
    codon="";
    {
        //here is where I'm having the trouble converting this to C# and have it cout the write
        //way                  
        codon.append(RNA.substr(beginIndex,endIndex-beginIndex));
    }
    for (k=0;k<64;k++)
    {
        if(codon==codons[k])
        {
             //here is where I'm having the trouble converting this to C# and have it cout the write way
             //like I metioned previously AAA GGG CCC couts Lysine Glycine Proline 
             protein.append(aminoAcids[k]);                
        }            
    }
    beginIndex+=3;
}
cout<<protein<<endl;
protein.clear();

这是我到目前为止在c＃中所拥有的内容

private void Tranlate_Click(object sender, EventArgs e)
{
    numberOfCodons = rnaLength / 3;
    beginIndex = 0;
    richTextBox2.AppendText("Total Number Of codons are: ");
    richTextBox2.AppendText(numberOfCodons.ToString());
    richTextBox2.AppendText("\n");
    for (i = 0; i < numberOfCodons; i++)
    {
        endIndex = beginIndex + 3;
        codon = "";                
        {
            // these are the two possible conversions of the C++ code that dont work at all for me******
            // codon.AppendText(RNA.Substring(beginIndex, endIndex - beginIndex));
            codon=(RNA.Substring(beginIndex, endIndex - beginIndex));
        }
        for (k = 0; k < 64; k++)
        {
            if (codon == codons[k])
            {
                //supposed to print out all the coresponding amino acids from the array and it will only print out one amino acid (Lysine)*******
                //protein.AppendText(aminoAcids[k]);
                protein = (aminoAcids[k]);
            }
        }
        beginIndex += 3;
    }
    richTextBox2.AppendText(protein);
    richTextBox2.AppendText("\n");
    //protein.clear();
}

为什么要这样做，我该如何解决？

Answer 1

尝试在循环中更改此行

protein = (aminoAcids[k]);

到

protein += (aminoAcids[k]);

C ++版本循环64次并附加到字符串，C＃版本每次都重新初始化字符串，并以比较if (codon == codons[k])找到的最后一个匹配结束。

密码子串发生同样的情况这会在每个循环中重新初始化

codon=(RNA.Substring(beginIndex, endIndex - beginIndex));

但是，在这种情况下，我不确定构建单个字符串是否正确，然后检查字符串数组，如codons[k]

PS。虽然他们对生成的代码不太熟悉，但我发现你对使用parenthesys的自由使用有点分散注意力。您可以撰写aminoAcids[k];和codon=RNA.Substring(beginIndex, endIndex - beginIndex);。这（在我看来）更清楚。

Answer 2

您的代码是LINQ的一个很好的候选者，它广泛用于C＃。如果我正确地理解了逻辑，你可以写出类似的东西：

richTextBox2.AppendText(string.Join("\n",
                                      Enumerable.Range(0, numberOfCodons)
                                        .Select(i => RNA.Substring(i * 3, i * 3 + 3))
                                        .Where(c => codons.Contains(c))
                                        .Select(c => aminoAcids[codons.IndexOf(c)])
                                        .ToArray())
                                    );

如何将整个数组附加到C＃中的字符串

2 个答案: