如何将EndNote xml文件转换为R数据帧

Question

我希望将EndNote生成的XML文件放入R数据框中。

我希望每个最终的子节点（例如标题，作者......）都是一列

此处提供了一个示例EndNote xml文件：

Example on gist

我还没有使用库（XML）来解决这个问题。我希望有人有一个现成的解决方案，抱歉，如果这听起来很懒散。

Answer 1

我有类似的问题要转换为数据帧。我在子节点上使用了xmlToDataFrame。

library(XML)
library(RCurl)
urldata<-"https://gist.github.com/raw/3831049/80f1315ba03d278b4f5f0d916fb1999709fc40e6/endnote.xml"
urldata<-xmlParse(getURL(urldata,ssl.verifypeer = FALSE,.opts=curlOptions(followlocation=TRUE)))
xmlToDataFrame(getNodeSet(urldata,'//*/record'))

#             database source-app rec-number foreign-keys ref-type
# 1 EndNote Ecology.enl    EndNote      13264        13264       17
# 2 EndNote Ecology.enl    EndNote      13265        13265       17
#        contributors                                  auth-address
# 1    Chapman, A. G. Cent States Forest Expt Stn, Columbus, OH USA
# 2 Strohecker, H. F.                 Univ Chicago, Chicago, IL USA
#                                                                                                     titles
# 1 An ecological basis for reforestation of submariginal lands in the Central Hardwood RegionEcologyEcology
# 2                                          A survey of soil temperatures in the Chicago areaEcologyEcology
#       periodical alt-periodical   pages volume number   dates      isbn
# 1 EcologyEcology EcologyEcology  93-105     18      1 1937Jan 0012-9658
# 2 EcologyEcology EcologyEcology 162-168     18      1 1937Jan 0012-9658
#         accession-num                                           notes
# 1 ISI:000200148800007  V02fg\rTimes Cited:5\rCited References Count:2
# 2 ISI:000200148800014 V02fg\rTimes Cited:5\rCited References Count:14
#                            urls language
# 1 <Go to ISI>://000200148800007  English
# 2 <Go to ISI>://000200148800014  English

多个作者可能存在一些问题（这里没有发生）等，如果一般使用的话可能需要稍作改动。