Question

我在matlab中执行fortran应用程序的输出时遇到了一些问题。我们使用Matlab调用许多fortran应用程序并显示输出和结果。

我在OSX上使用gfortran来构建其中一个程序，它会执行大量文件输出和一些输出到stdout来跟踪进度。 stdout输出主要通过print *语句完成，但我也试过写（*，*）。该程序使用OpenMP，但是在OpenMP并行部分中没有执行print *或write（*，*）语句。当从终端执行程序时，一切正常。但是，当从matlab中执行程序时，stdout没有输出。文件输出工作正常。

此外，使用Intel的ifort编译时，相同的代码会在matlab中显示其输出而不会出现问题。不幸的是，我无法定期访问英特尔编译器。

我很肯定输出是stdout（而不是stderr），我已经尝试从代码中刷新两者（调用flush（6）＆amp; call flush（0）），但这不是似乎有所作为。

我不确定是什么原因引起的。有什么想法吗？

一些相关信息：操作系统：OSX 10.6.8（64位模式）

Matlab：R2012b

gfortran：4.7.2（通过fink获得）

编译标志：-cpp -fopenmp -ffree-line-length-0 -fno-range-check -m64 -static-libgfortran -fconvert = little-endian -fstrict-aliasing

修改

我做了一些测试，创建了一个简单的'hello'程序：

program printTest
write (*,*) 'hello'
end program

用...编译

gfortran test.f90 -o test

表现出相同的行为。

我也尝试使用早期版本的gfortran（4.2.1）进行编译，这产生了一些有趣的结果。它在终端中执行正常，但在matlab中我得到以下内容：

！./测试     dyld：惰性符号绑定失败：未找到符号：__ gfortran_set_std       参考自：/Users/sah/Desktop/./test       预期在：/Applications/MATLAB_R2012b.app/sys/os/maci64/libgfortran.2.dylib

dyld：未找到符号：__ gfortran_set_std       参考自：/Users/sah/Desktop/./test       预期在：/Applications/MATLAB_R2012b.app/sys/os/maci64/libgfortran.2.dylib

./ test：跟踪/断点陷阱

这让我相信它是一个图书馆问题。在这种情况下，使用-static-libgfortran会产生相同的结果。

Answer 1

我相信Matlab是一个单线程应用程序。当你调用一个多线程执行程序时，我已经看到了将输出传回Matlab的各种问题。您是否考虑过重新编译成Fortran mex文件？

Answer 2

我不确定mex文件是否会比独立的可执行文件更好地打印到stdout。

还有其他选择。一种是将所有诊断信息写入（附加）到文件中，然后在需要时查看文件。例如，Emacs每秒自动“恢复”文件的内容，或者你设置间隔的任何内容。另一个选择可能是将fortran源转换为matlab源代码（参见f2matlab）并将其全部保存在matlab中。

BB

Answer 3

根据system function documentation

[status，result] = system（'command'）返回状态变量的完成状态，并将结果返回给结果变量。

[status，result] = system（'command'，' - echo'）也强制输出到命令窗口。

所以你应该在系统调用中使用'-echo'参数直接在命令窗口中查看输出

system(['cd "',handles.indir,'";chmod u+x ./qp.exe',... ';./qp.exe'], '-echo')

或者您可以将stdout分配给变量：

[ret txt] = system(['cd "',handles.indir,'";chmod u+x ./qp.exe',... ';./qp.exe'])

fortran应用程序的输出未显示在Matlab中

3 个答案: