在David Robinson提出一些非常好的问题后,我意识到我最初的问题并不准确。
我认为我的问题只是一个两步,
首先,我需要查看我的数据,以确定只有id
time
的{{1}}个人,并在intake_arm_1
中创建一个只包含#的新行,{ {1}}中的{1}}和id
中的#。要在v_001_arm_1
和time
之间获得正确的匹配,请使用c_n
表。
其次,如果最新的 arm 已注册t_name
,我需要在{v_001_arm_1'c_name
内的lookup
内执行更多或更少的相同操作id
,按v_010_arm_1
计算这些实例,并将这些数字写入ti_all
和ty_all
列。此外,如果最新的out_c
不是NA,我还必须将名称编号从out_c
传输到此新行。
新 v_00n_arm_1 的#应为“当前加亮数字”(例如intake_arm_1
)+ 1(例如ti_all
)。
我将努力手动制作一个强化我的目标的例子。
v_007_arm_1
这就是我的目标(除非我做了一个错字),
v_008_arm_1
ps:我看到人们用lookup <- structure(list(c_name = c(1L, 2L, 4L, 5L, 6L, 7L), t_name = structure(1:6, .Label = c("Bob", "Julian", "Mitt", "Ricky", "Tom", "Victor"), class = "factor")), .Names = c("c_name", "t_name"), class = "data.frame", row.names = c("1", "2", "3", "4", "5", "6"))
> lookup
c_name t_name
1 1 Bob
2 2 Julian
3 4 Mitt
4 5 Ricky
5 6 Tom
6 7 Victor
mydata <- structure(list(id = c(1L, 1L, 2L, 3L, 4L, 4L, 4L, 4L, 4L, 4L, 4L, 4L, 5L, 5L, 6L, 7L, 7L, 7L, 7L, 8L, 9L), time = c("intake_arm_1", "v_001_arm_1", "intake_arm_1", "intake_arm_1", "intake_arm_1", "v_001_arm_1", "v_002_arm_1", "v_003_arm_1", "v_004_arm_1", "v_005_arm_1", "v_006_arm_1", "v_007_arm_1", "intake_arm_1", "v_001_arm_1", "intake_arm_1", "intake_arm_1", "v_011_arm_1", "v_012_arm_1", "v_013_arm_1", "intake_arm_1", "intake_arm_1"), dat_all = c(NA, NA, NA, NA, NA, NA, NA, "2012-09-23", "2012-09-23", "2012-09-02", "2012-09-10", "2012-09-23", NA, NA, NA, NA, "2012-09-23", "2012-09-23", "2012-09-23", NA, NA), ti_all = c(NA, NA, NA, NA, NA, NA, NA, 6L, 44L, 33L, NA, 22L, NA, NA, NA, NA, 65L, NA, 10L, NA, NA), ty_all = c(NA, NA, NA, NA, NA, NA, NA, "out_", "out_", "cma_", NA, "cma_", NA, NA, NA, NA, "out_", "out_", "out_", NA, NA), out_c = c(NA, NA, NA, NA, NA, NA, NA, NA, NA, NA, NA, NA, NA, NA, NA, NA, NA, NA, NA, NA, NA), cma_c = c(NA, NA, NA, NA, NA, NA, NA, NA, NA, NA, NA, NA, NA, NA, NA, NA, NA, NA, NA, NA, NA), c_n = c(NA, 1L, NA, NA, NA, NA, NA, 7L, 4L, 7L, NA, 1L, NA, 2L, NA, NA, 7L, 7L, 7L, NA, NA), t_name = c("Tom", NA, "Ricky", "Ricky", "Victor", NA, NA, NA, NA, NA, NA, NA, "Julian", NA, "Julian", "Bob", NA, NA, NA, "Mitt", "Mitt")), .Names = c("id", "time", "dat_all", "ti_all", "ty_all", "out_c", "cma_c", "c_n", "t_name"), class = "data.frame", row.names = c("1", "2", "3", "4", "5", "6", "7", "8", "9", "10", "11", "12", "13", "14", "15", "16", "17", "18", "19", "20", "21"))
> mydata
id time dat_all ti_all ty_all out_c cma_c c_n t_name
1 1 intake_arm_1 NA NA NA NA NA NA Tom
2 1 v_001_arm_1 NA NA NA NA NA 1 NA
3 2 intake_arm_1 NA NA NA NA NA NA Ricky
4 3 intake_arm_1 NA NA NA NA NA NA Ricky
5 4 intake_arm_1 NA NA NA NA NA NA Victor
6 4 v_001_arm_1 NA NA NA NA NA NA NA
7 4 v_002_arm_1 NA NA NA NA NA NA NA
8 4 v_003_arm_1 2012-09-23 6 out_ NA NA 7 NA
9 4 v_004_arm_1 2012-09-23 44 out_ NA NA 4 NA
10 4 v_005_arm_1 2012-09-02 33 cma_ NA NA 7 NA
11 4 v_006_arm_1 2012-09-10 NA NA NA NA NA NA
12 4 v_007_arm_1 2012-09-23 22 cma_ NA NA 1 NA
13 5 intake_arm_1 NA NA NA NA NA NA Julian
14 5 v_001_arm_1 NA NA NA NA NA 2 NA
15 6 intake_arm_1 NA NA NA NA NA NA Julian
16 7 intake_arm_1 NA NA NA NA NA NA Bob
17 7 v_011_arm_1 2012-09-23 65 out_ NA NA 7 NA
18 7 v_012_arm_1 2012-09-23 NA out_ NA NA 7 NA
19 7 v_013_arm_1 2012-09-23 10 out_ NA NA 7 NA
20 8 intake_arm_1 NA NA NA NA NA NA Mitt
21 9 intake_arm_1 NA NA NA NA NA NA Mitt
和 id time dat_all ti_all ty_all out_c cma_c c_n t_name
1 1 intake_arm_1 NA NA NA NA NA NA Tom
2 1 v_001_arm_1 NA NA NA NA NA 1 NA
3 2 intake_arm_1 NA NA NA NA NA NA Ricky
4 2 v_001_arm_1 NA NA NA NA NA 5 NA
5 3 intake_arm_1 NA NA NA NA NA NA Ricky
6 3 v_001_arm_1 NA NA NA NA NA 5 NA
7 4 intake_arm_1 NA NA NA NA NA NA Victor
7 4 v_001_arm_1 NA NA NA NA NA NA NA
8 4 v_002_arm_1 NA NA NA NA NA NA NA
9 4 v_003_arm_1 2012-09-23 6 out_ 1 NA 7 NA
10 4 v_004_arm_1 2012-09-23 44 out_ 2 NA 4 NA
11 4 v_005_arm_1 2012-09-02 33 cma_ 2 1 7 NA
12 4 v_006_arm_1 2012-09-10 NA NA 2 1 NA NA
13 4 v_007_arm_1 2012-09-23 22 cma_ 2 2 1 NA
14 4 v_008_arm_1 NA NA NA 2 2 7 NA
15 5 intake_arm_1 NA NA NA NA NA NA Julian
16 5 v_001_arm_1 NA NA NA NA NA 2 NA
17 6 intake_arm_1 NA NA NA NA NA NA Julian
18 6 v_001_arm_1 NA NA NA NA NA 2 NA
19 7 intake_arm_1 NA NA NA NA NA NA Bob
20 7 v_011_arm_1 2012-09-23 65 out_ 1 NA 7 NA
21 7 v_012_arm_1 2012-09-23 NA out_ 1 NA 7 NA
22 7 v_013_arm_1 2012-09-23 10 out_ 2 NA 7 NA
23 7 v_014_arm_1 NA NA NA 2 NA 1 NA
24 8 intake_arm_1 NA NA NA NA NA NA Mitt
25 8 v_001_arm_1 NA NA NA NA NA 4 NA
26 9 intake_arm_1 NA NA NA NA NA NA Mitt
27 9 v_001_arm_1 NA NA NA NA NA 4 NA
做了惊人的事情。
答案 0 :(得分:5)
以下是使用plyr的解决方案:
lookup <- structure(list(c_name = c(1L, 2L, 4L, 5L, 6L, 7L), t_name = structure(1:6, .Label = c("Bob", "Julian", "Mitt", "Ricky", "Tom", "Victor"), class = "factor")), .Names = c("c_name", "t_name"), class = "data.frame", row.names = c("1", "2", "3", "4", "5", "6"))
mydata <- structure(list(id = c(1L, 1L, 2L, 3L, 4L, 4L, 4L, 4L, 4L, 4L, 4L, 4L, 5L, 5L, 6L, 7L, 7L, 7L, 7L, 8L, 9L), time = c("intake_arm_1", "v_001_arm_1", "intake_arm_1", "intake_arm_1", "intake_arm_1", "v_001_arm_1", "v_002_arm_1", "v_003_arm_1", "v_004_arm_1", "v_005_arm_1", "v_006_arm_1", "v_007_arm_1", "intake_arm_1", "v_001_arm_1", "intake_arm_1", "intake_arm_1", "v_011_arm_1", "v_012_arm_1", "v_013_arm_1", "intake_arm_1", "intake_arm_1"), dat_all = c(NA, NA, NA, NA, NA, NA, NA, "2012-09-23", "2012-09-23", "2012-09-02", "2012-09-10", "2012-09-23", NA, NA, NA, NA, "2012-09-23", "2012-09-23", "2012-09-23", NA, NA), ti_all = c(NA, NA, NA, NA, NA, NA, NA, 6L, 44L, 33L, NA, 22L, NA, NA, NA, NA, 65L, NA, 10L, NA, NA), ty_all = c(NA, NA, NA, NA, NA, NA, NA, "out_", "out_", "cma_", NA, "cma_", NA, NA, NA, NA, "out_", "out_", "out_", NA, NA), out_c = c(NA, NA, NA, NA, NA, NA, NA, NA, NA, NA, NA, NA, NA, NA, NA, NA, NA, NA, NA, NA, NA), cma_c = c(NA, NA, NA, NA, NA, NA, NA, NA, NA, NA, NA, NA, NA, NA, NA, NA, NA, NA, NA, NA, NA), c_n = c(NA, 1L, NA, NA, NA, NA, NA, 7L, 4L, 7L, NA, 1L, NA, 2L, NA, NA, 7L, 7L, 7L, NA, NA), t_name = c("Tom", NA, "Ricky", "Ricky", "Victor", NA, NA, NA, NA, NA, NA, NA, "Julian", NA, "Julian", "Bob", NA, NA, NA, "Mitt", "Mitt")), .Names = c("id", "time", "dat_all", "ti_all", "ty_all", "out_c", "cma_c", "c_n", "t_name"), class = "data.frame", row.names = c("1", "2", "3", "4", "5", "6", "7", "8", "9", "10", "11", "12", "13", "14", "15", "16", "17", "18", "19", "20", "21"))
library(plyr)
newrows <- ddply(mydata, .(id), function(subdata) {
subdata_ty = subdata[!is.na(subdata$ty_all), ]
if (NROW(subdata) == 1) {
r = subdata[1, ]
c("v_001_arm_1", NA, NA, NA, NA, NA,
lookup$c_name[lookup$t_name == r$t_name], r$t_name)
}
else if (NROW(subdata_ty) > 0 & !is.na(subdata_ty[NROW(subdata_ty), ]$dat_all)) {
numbers = sapply(strsplit(subdata$time, "_"), function(l)
ifelse(l[1] != "intake", as.numeric(l[2]), 0))
newname = paste(c("v", sprintf("%03d", max(numbers) + 1), "arm", "1"),
collapse="_")
r1 = subdata[1, ]
new_c_n = lookup$c_name[lookup$t_name == r1$t_name]
new_out_c = sum(subdata$ty_all == "out_" & !is.na(subdata$ti_all))
new_cma_c = sum(subdata$ty_all == "cma_" & !is.na(subdata$ti_all))
# you want them to be NA instead of 0:
new_out_c = ifelse(new_out_c == 0, NA, new_out_c)
new_cma_c = ifelse(new_cma_c == 0, NA, new_cma_c)
return(c(newname, NA, NA, NA, new_out_c, new_cma_c, new_c_n, NA))
}
})
# recombine and sort
colnames(newrows) = colnames(mydata)
newdata = rbind(mydata, newrows)
newdata = newdata[order(newdata$id), ]