R包iGraph中的循环循环

Question

使用iGraph，我如何用圆形曲线表示自反节点？默认情况下，这些曲线由压缩或泪滴形状的环表示。

Answer 1

正如Spacedman所说，你需要做一些编程才能做到这一点。你可以绘制一个没有自循环的图形然后添加它们（图形基本上是一个散点图，你可以使用points和类似的函数来为它们添加线条），但这不是微不足道的（特别是因为你需要知道节点的边缘，而不是它们的中心），并且会导致自循环被绘制在其他可能看起来不太好的东西之上。

本周末，我更新了qgraph自我循环的工作原理。 qgraph可用于绘制网络，并且可以与igraph很好地配合使用。 e.g：

# An adjacency matrix:
A <- matrix(1,3,3)

library("igraph")
# igraph graph and layout:
Graph <- graph.adjacency(A)
Layout <- layout.circle(Graph)

# Plot in qgraph:
library("qgraph")
qgraph(get.adjacency(Graph,sparse=FALSE),layout=Layout,diag=TRUE,directed=TRUE)

我非常满意这些自我循环的结果，它们似乎更符合你的描述。所以这可能是一个选择。但是，我的循环就像硬编码一样。作为参考，我使用内部函数qgraph:::Cent2Edge计算节点的边缘（循环的起点和终点），并使用内部函数qgraph:::SelfLoop计算循环的形状（样条曲线）。

Answer 2

在plot.igraph内，您可以看到使用plot.bezier函数绘制循环，并且对此进行的所有控制都非常难以编码。您必须重写plot.igraph的大块来调用您必须写的plot.circle函数才能执行此操作。

另外，我猜你不想要完整的圆圈，但是在顶点符号的边缘（带有顶点数字的默认蓝色圆圈）开始并且结束的圆圈段（可能带有圆圈）一个箭头）在顶点符号边缘的另一部分？或者你是否想要像bezier泪滴环一样触摸符号的圆圈？

无论哪种方式，答案似乎都是“不”，不是没有做一些编程或向igraph人提交功能请求＆＃39;

我发布了一个早先的答案，说明了布局功能，但事实并非如此 - 布局功能只定位顶点，绘制边缘是plot.igraph的工作。