从Writing R Extensions Manual开始，我读到了
从R 2.14.0开始，Sweave源的首选位置是 源包的子目录vignet，但为了兼容性 使用早期版本的R，将查找晕影源 inst / doc如果没有晕影。
但是，当我创建包源的vignettes子目录时，当我运行devtools::check()或R CMD check时，我会收到Package vignette(s) without corresponding PDF的警告。如果我将小插图（.Rnw和.pdf）放在inst/doc中，则检查完成后无需投诉。我尝试在已安装的打包中查看我的库，但没有看到任何名为vignettes的目录。我还应该使用已弃用的位置吗？
答案 0 :(得分：20)
您将.Rnw来源放在vignettes/中，但是您错过了一个关键步骤;不要检查源树。预期的工作流程是构建源tarball，然后检查tarball。构建tarball将创建小插图PDF。
R CMD build ../foo/pkg
R CMD check ./pkg-0.4.tar.gz
将从../foo/pkg中的源代码构建源包tarball，在当前目录中创建.tar.gz包，并附加包名和版本。然后在该源包上运行R CMD check。
如果您希望为您构建的插图将其放入vignettes/并构建源包。在将来某个日期，R Core可能会删除从inst/doc构建小插图的功能，因此请立即使用建议的位置，并避免直接检查来源。
答案 1 :(得分：13)
我也很难解释这一点。
我认为您应该将.Rnw文件放在vignettes/中，并将PDF（适当压缩）放在inst/doc/中，如果您仔细阅读，则在技术上与文档一致。 （也就是说，它说来源应该进入vignettes/。我没有看到它在多少单词中所说的内容，你应该将相应的PDF放在inst/doc/中，但它没有不说出来，而这种解释似乎让R CMD check感到高兴......）
该解决方案在@ GavinSimpson的答案中（即一个人应该构建tarball然后检查它，而不是检查源目录本身）。 （我的两分钱是，如果R-core正式弃用（并最终删除）直接来源检查而不是混淆我们所有的基础......可能是最好的。）