查找完全相关/冗余的数字和字符列

时间:2012-09-04 22:10:10

标签: r correlation

我有一个包含数百列的数据集。它包含邮件列表数据,其中几列似乎是彼此完全相同但形式不同。

例如:

rowNum    StateCode       StateName      StateAbbreviation
  1          01             UTAH               UT
  2          01             UTAH               UT
  3          03             TEXAS              TX
  4          03             TEXAS              TX
  5          03             TEXAS              TX
  6          44             OHIO               OH
  7          44             OHIO               OH
  8          44             OHIO               OH
 ...         ...            ...                ...

我想删除重叠数据并尽可能保留数字列,因此只有一列包含相同的信息。因此,上面的例子将成为:

rowNum    StateCode
      1          01 
      2          01   
      3          03  
      4          03  
      5          03 
      6          44
      7          44
      8          44 
     ...         ...  

我尝试过使用cor(),但这仅适用于数字变量。我已经尝试了caret::nearZeroVar()但这只适用于列本身。

有没有人建议找到涉及非数字数据的完全相关的列?

感谢。

4 个答案:

答案 0 :(得分:5)

这是一个有趣而快速的解决方案。它首先将data.frame转换为适当结构的整数类矩阵,然后使用cor()来标识冗余列。

## Read in the data
df <- read.table(text="rowNum    StateCode       StateName      StateAbbreviation
  1          01             UTAH               UT
  2          01             UTAH               UT
  3          03             TEXAS              TX
  4          03             TEXAS              TX
  5          03             TEXAS              TX
  6          44             OHIO               OH
  7          44             OHIO               OH
  8          44             OHIO               OH", header=TRUE)

## Convert data.frame to a matrix with a convenient structure
## (have a look at m to see where this is headed)
l <- lapply(df, function(X) as.numeric(factor(X, levels=unique(X))))
m <- as.matrix(data.frame(l))

## Identify pairs of perfectly correlated columns    
M <- (cor(m,m)==1)
M[lower.tri(M, diag=TRUE)] <- FALSE

## Extract the names of the redundant columns
colnames(M)[colSums(M)>0]
[1] "StateName"         "StateAbbreviation"

答案 1 :(得分:3)

这可以解决这个问题吗?我基于这个想法,如果你打电话给table(col1, col2), 如果列是重复的,则表中的任何列只有一个非零值,例如:

     OHIO TEXAS UTAH
  1     0     0    2
  3     0     3    0
  44    3     0    0

这样的事情:

dup.cols <- read.table(text='rowNum    StateCode       StateName      StateAbbreviation
  1          01             UTAH               UT
  2          01             UTAH               UT
  3          03             TEXAS              TX
  4          03             TEXAS              TX
  5          03             TEXAS              TX
  6          44             OHIO               OH
  7          44             OHIO               OH
  8          44             OHIO               OH', header=T)
library(plyr)
combs <- combn(ncol(dup.cols), 2)
adply(combs, 2, function(x) {
  t <- table(dup.cols[ ,x[1]], dup.cols[ , x[2]])
  if (all(aaply(t1, 2, function(x) {sum(x != 0) == 1}))) {
    paste("Column numbers ", x[1], x[2], "are duplicates")
  }
})

答案 2 :(得分:1)

这应该会返回一张地图,告诉你哪些变量相互匹配。

check.dup <- expand.grid(names(dat),names(dat)) #find all variable pairs
check.dup[check.dup$Var1 != check.dup$Var2,] #take out self-reference
check.dup$id <- mapply(function(x,y) {
        x <- as.character(x); y <- as.character(y)
            #if number of levels is different, discard; keep the number for later
        if ((n <- length(unique(dat[,x]))) != length(unique(dat[,y])))  {
            return(FALSE)
            }
            #subset just the variables in question to get pairs
        d <- dat[,c(x,y)]
            #find unique pairs
        d <- unique(d)
            #if number of unique pairs is the number of levels from before,
            #then the pairings are one-to-one
        if( nrow(d) == n ) {
            return(TRUE)
        } else return(FALSE)
    },
    check.dup$Var1,
    check.dup$Var2
)

答案 3 :(得分:0)

 dat <- read.table(text="rowNum    StateCode       StateName     
   1          01             UTAH
   2          01             UTAH
   3          03             TEXAS
   4          03             TEXAS 
   5          03             TEXAS 
   6          44             OHIO
   7          44             OHIO
   8          44             OHIO", header=TRUE)

 dat [!duplicated(dat[, 2:3]), ]
#------------
  rowNum StateCode StateName
1      1         1      UTAH
3      3         3     TEXAS
6      6        44      OHIO