如何在我的python包中包含pandas库?

时间:2012-09-01 13:01:36

标签: import module pandas

我必须在我的软件包中包含pandas库,以便在没有安装pandas库但具有所有正确依赖关系的集群服务器上运行我的软件。

我尝试在我的电脑上构建来自源代码(版本0.8.1)的pandas库:

python setup.py build_ext --inplace

如果我将构建的pandas文件夹移动到我的电脑中的其他文件夹中的任何位置,我可以在我的软件中导入它(例如./mySoftwareFolder/pandas)

但是当我在群集服务器上使用pandas libray移动我的软件时,它会引发错误:

File "testPandas.py", line 9, in <module>
    import pandas
File "/home/TEST/pandas/__init__.py", line 15, in <module>

raise ImportError('C extensions not built: if you installed already '
ImportError: C extensions not built: if you installed already verify that you are not importing from the source directory

就好像它没有编译一样。

我的方式包括库有什么问题?

非常感谢!

更新: 我复制到集群服务器的目录包含:

-bash-4.2$ ll -a pandas
totale 11476
drwxr-xr-x. 14 francesco dottor    4096  1 set 13.37 .
drwxr-xr-x. 10 francesco dottor    8192  1 set 13.36 ..
-rwxr-xr-x.  1 francesco dottor 2648299  1 set 13.36 _algos.so
drwxr-xr-x.  2 francesco dottor    4096  1 set 13.36 compat
drwxr-xr-x.  2 francesco dottor    4096  1 set 13.36 core
-rw-r--r--.  1 francesco dottor     394  1 set 13.36 info.py
-rw-r--r--.  1 francesco dottor     557  1 set 13.36 info.pyc
-rw-r--r--.  1 francesco dottor    1269  1 set 13.36 __init__.py
-rw-r--r--.  1 francesco dottor    1643  1 set 13.37 __init__.pyc
drwxr-xr-x.  3 francesco dottor    4096  1 set 13.36 io
-rwxr-xr-x.  1 francesco dottor 7437108  1 set 13.36 lib.so
-rwxr-xr-x.  1 francesco dottor  474199  1 set 13.36 _period.so
drwxr-xr-x.  2 francesco dottor    4096  1 set 13.36 rpy
drwxr-xr-x.  3 francesco dottor    4096  1 set 13.36 sandbox
-rw-r--r--.  1 francesco dottor     844  1 set 13.36 setup.py
drwxr-xr-x.  3 francesco dottor    4096  1 set 13.36 sparse
-rwxr-xr-x.  1 francesco dottor 1065313  1 set 13.36 _sparse.so
drwxr-xr-x.  3 francesco dottor    4096  1 set 13.36 src
drwxr-xr-x.  3 francesco dottor    4096  1 set 13.36 stats
drwxr-xr-x.  3 francesco dottor    4096  1 set 13.36 tests
drwxr-xr-x.  3 francesco dottor    4096  1 set 13.36 tools
drwxr-xr-x.  3 francesco dottor    4096  1 set 13.36 tseries
drwxr-xr-x.  2 francesco dottor    4096  1 set 13.36 util
-rw-r--r--.  1 francesco dottor      42  1 set 13.36 version.py
-rw-r--r--.  1 francesco dottor     204  1 set 13.36 version.pyc

1 个答案:

答案 0 :(得分:0)

您在哪个平台上构建C扩展?在群集计算机上,验证扩展共享对象(Linux / OSX上的.so文件和Windows上的.pyd文件)是否位于您复制的文件夹中:

08:21 ~/code/pandas/pandas  $ ll
total 12568
-rw-r--r--   1 wesm  staff     1269 Aug 25 04:49 __init__.py
-rw-r--r--   1 wesm  staff     1645 Aug 25 04:52 __init__.pyc
-rwxr-xr-x   1 wesm  staff   799464 Aug 25 04:50 _algos.so
-rwxr-xr-x   1 wesm  staff    65712 Aug 25 04:48 _engines.so
-rwxr-xr-x   1 wesm  staff   197056 Sep  1 22:13 _period.so
-rwxr-xr-x   1 wesm  staff   341032 Aug 25 04:53 _sparse.so
drwxr-xr-x   6 wesm  staff      204 Aug 25 04:52 compat
drwxr-xr-x  44 wesm  staff     1496 Sep  1 17:34 core
drwxr-xr-x   3 wesm  staff      102 Aug 25 04:49 finance
-rw-r--r--   1 wesm  staff      394 Aug 25 04:49 info.py
-rw-r--r--   1 wesm  staff      535 Aug 25 04:52 info.pyc
drwxr-xr-x  15 wesm  staff      510 Sep  1 23:14 io
-rwxr-xr-x   1 wesm  staff  2490600 Sep  1 22:13 lib.so
drwxr-xr-x   9 wesm  staff      306 Sep  1 17:34 rpy
drwxr-xr-x   6 wesm  staff      204 May 20 19:13 sandbox
-rw-r--r--   1 wesm  staff      844 Feb 22  2012 setup.py
drwxr-xr-x  17 wesm  staff      578 Aug 25 04:52 sparse
drwxr-xr-x  55 wesm  staff     1870 Sep  1 22:57 src
drwxr-xr-x  23 wesm  staff      782 Aug 25 04:52 stats
drwxr-xr-x  40 wesm  staff     1360 Sep  1 17:34 tests
drwxr-xr-x  16 wesm  staff      544 Aug 25 04:52 tools
drwxr-xr-x  28 wesm  staff      952 Sep  1 17:34 tseries
drwxr-xr-x  18 wesm  staff      612 Aug 25 04:52 util
-rw-r--r--   1 wesm  staff       54 Sep  1 22:57 version.py
-rw-r--r--   1 wesm  staff      204 Sep  1 22:58 version.pyc